RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 RHBDF2Q6PJF5 856 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 ALKAL1Q6UXT8 129 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 RFX8Q6ZV50 586 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 ECHDC2Q86YB7 292 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 TRIML2Q8N7C3 387 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 STARD8Q92502 1023 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 SCYL1Q96KG9 808 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 SMOQ99835 787 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 PRM3Q9NNZ6 103 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 TCF7L2Q9NQB0 619 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGEF4Q9NR80 690 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 CREBZFQ9NS37 354 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 DTLQ9NZJ0 730 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 SENP1Q9P0U3 644 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 LRCH1Q9Y2L9 728 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 NME7Q9Y5B8 376 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1W2PPM1 405 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 DGKIO75912 1065 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 ITGB1P05556 798 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 CKBP12277 381 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 CPA3P15088 417 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 CES1P23141 567 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 PSMB4P28070 264 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 PCSK7Q16549 785 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 MSS51Q4VC12 460 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF280BQ86YH2 543 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 ATPAF2Q8N5M1 289 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 FBXO32Q969P5 355 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 TLCD1Q96CP7 247 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 P2RY11Q96G91 374 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 OLFM3Q96PB7 478 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM209Q96SK2 561 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 FSD1LQ9BXM9 530 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 EPB41L4BQ9H329 900 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 IL20Q9NYY1 176 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1W2PQ67 120 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 ADAMTS4O75173 837 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 TOMM70O94826 608 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 SLC4A1P02730 911 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 RAB15P59190 212 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 DPYSL2Q16555 572 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 QPCTQ16769 361 aa8□□□□□ -1.13
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TRPS1-208ENST00000519076 IL23RQ5VWK5 629 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 SIGIRRQ6IA17 410 aa8□□□□□ -1.13
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TRPS1-208ENST00000519076 TMEM151BQ8IW70 566 aa8□□□□□ -1.13
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TRPS1-208ENST00000519076 VPS50Q96JG6 964 aa8□□□□□ -1.13
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TRPS1-208ENST00000519076 TRIM62Q9BVG3 475 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 TXLNGYQ9BZA5 131 aa8□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 VPS11Q9H270 941 aa8□□□□□ -1.13
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TRPS1-208ENST00000519076 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 SCLYQ96I15 445 aa7.99□□□□□ -1.13
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TRPS1-208ENST00000519076 SPON2Q9BUD6 331 aa7.99□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 B3GNT4Q9C0J1 378 aa7.99□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 STK38LQ9Y2H1 464 aa7.99□□□□□ -1.13
TRPS1-208ENST00000519076 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
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