RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513331.1

GFM2-208, Transcript of G elongation factor mitochondrial 2, human

TSL 2

Gene GFM2, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GFM2-208	ENST00000513331	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	TULP2	O00295	520 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	PPEF2	O14830	753 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	NBN	O60934	754 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	MOSPD3	O75425	235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	PTGER1	P34995	402 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	KCNJ4	P48050	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	C1QTNF8	P60827	252 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	POSTN	Q15063	836 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	RABEP1	Q15276	862 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	PANK2	Q9BZ23	570 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	RAI14	Q9P0K7	980 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	PNMA2	Q9UL42	364 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	NUDC	Q9Y266	331 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331		E7EVH7	732 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	UGDH	O60701	494 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	NFATC1	O95644	943 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ADPRH	P54922	357 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	FSIP1	Q8NA03	581 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	THAP4	Q8WY91	577 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	TRMO	Q9BU70	441 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	MAF1	Q9H063	256 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	KCND3	Q9UK17	655 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ATRN	O75882	1429 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	DIP2A	Q14689	1571 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	IRAK2	O43187	625 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	SEPT4	O43236	478 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	FAM155B	O75949	473 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	KRT38	O76015	456 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	PAX3	P23760	479 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ADD2	P35612	726 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	STAT1	P42224	750 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	OAZ1	P54368	228 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	PRKAA2	P54646	552 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	DCTN1	Q14203	1278 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	PGM5	Q15124	567 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	DLGAP5	Q15398	846 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	SYT13	Q7L8C5	426 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	MDGA2	Q7Z553	956 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GFM2-208	ENST00000513331	EXD3	Q8N9H8	876 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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