RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 PREBQ9HCU5 417 aa25.26■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 CHD6Q8TD26 2715 aa25.25■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 ZZEF1O43149 2961 aa25.25■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 A0A0D9SEW6 157 aa25.25■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 K7ERQ8 282 aa25.25■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 SRGAP2O75044 1071 aa25.25■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 CAPNS1P04632 268 aa25.25■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 CTSLP07711 333 aa25.25■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 KRT31Q15323 416 aa25.25■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 SHBQ15464 509 aa25.25■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC157Q569K6 752 aa25.25■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 FKBP15Q5T1M5 1219 aa25.25■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 CDKAL1Q5VV42 579 aa25.25■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 CLEC17AQ6ZS10 378 aa25.25■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 MFSD2AQ8NA29 543 aa25.25■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 OR2A12Q8NGT7 310 aa25.25■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 SAP25Q8TEE9 199 aa25.25■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 SLC20A1Q8WUM9 679 aa25.25■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 LMBRD1Q9NUN5 540 aa25.25■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 CHRNA3P32297 505 aa25.24■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 KLK7P49862 253 aa25.24■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 CDR2Q01850 454 aa25.24■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 C22orf39Q6P5X5 142 aa25.24■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 LINGO4Q6UY18 593 aa25.24■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF783Q6ZMS7 281 aa25.24■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 IQCHQ86VS3 1027 aa25.24■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 EMC1Q8N766 993 aa25.24■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 OR7D4Q8NG98 312 aa25.24■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 ZYG11BQ9C0D3 744 aa25.24■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa25.24■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 DYRK4Q9NR20 520 aa25.24■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 ILVBLA1L0T0 632 aa25.23■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 MAGEC1O60732 1142 aa25.23■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 PRNPP04156 253 aa25.23■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 ATP11AP98196 1134 aa25.23■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC15Q0P6D6 951 aa25.23■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 OVGP1Q12889 678 aa25.23■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa25.23■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 TMIEQ8NEW7 156 aa25.23■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa25.23■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 FREM2Q5SZK8 3169 aa25.23■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa25.22■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 CBX4O00257 560 aa25.22■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 TAF4O00268 1085 aa25.22■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 MMP8P22894 467 aa25.22■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 GLDCP23378 1020 aa25.22■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 SOX5P35711 763 aa25.22■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 JAM2P57087 298 aa25.22■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 TAS2R38P59533 333 aa25.22■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 FMO1Q01740 532 aa25.22■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 STAT4Q14765 748 aa25.22■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 RETSATQ6NUM9 610 aa25.22■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 ARRDC3Q96B67 414 aa25.22■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 C11orf70Q9BRQ4 267 aa25.22■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 SPON2Q9BUD6 331 aa25.22■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 ATP13A1Q9HD20 1204 aa25.22■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 NLRC4Q9NPP4 1024 aa25.22■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF212Q9UDV6 495 aa25.22■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 IL36AQ9UHA7 158 aa25.22■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 ENC1O14682 589 aa25.21■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 SDC4P31431 198 aa25.21■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 RXRGP48443 463 aa25.21■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 CDO1Q16878 200 aa25.21■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 ARL13BQ3SXY8 428 aa25.21■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 ARTNQ5T4W7 220 aa25.21■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 DHRS13Q6UX07 377 aa25.21■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 TRIM72Q6ZMU5 477 aa25.21■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 CHST14Q8NCH0 376 aa25.21■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa25.21■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 PPP1R16AQ96I34 528 aa25.21■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 TNKS2Q9H2K2 1166 aa25.21■■□□□ 1.63
ALYREF-203ENST00000511412 EPHB6O15197 1021 aa25.2■■□□□ 1.62
ALYREF-203ENST00000511412 ENDOD1O94919 500 aa25.2■■□□□ 1.62
ALYREF-203ENST00000511412 GNA12Q03113 381 aa25.2■■□□□ 1.62
ALYREF-203ENST00000511412 NEK5Q6P3R8 708 aa25.2■■□□□ 1.62
ALYREF-203ENST00000511412 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
ALYREF-203ENST00000511412 DRC7Q8IY82 874 aa25.2■■□□□ 1.62
ALYREF-203ENST00000511412 EID2Q8N6I1 236 aa25.2■■□□□ 1.62
ALYREF-203ENST00000511412 MDM1Q8TC05 714 aa25.2■■□□□ 1.62
ALYREF-203ENST00000511412 CEP44Q9C0F1 390 aa25.2■■□□□ 1.62
ALYREF-203ENST00000511412 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.8 ms