RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494043.1

MCF2L-231, Transcript of MCF.2 cell line derived transforming sequence like, human

TSL 3

Gene MCF2L, Length 896 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MCF2L-231	ENST00000494043	GLDC	P23378	1020 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	IVD	P26440	423 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	ADCY8	P40145	1251 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	NUMB	P49757	651 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	GPS1	Q13098	491 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	NR1H3	Q13133	447 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	DMC1	Q14565	340 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	FUT11	Q495W5	492 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	TEX44	Q53QW1	395 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	C12orf40	Q86WS4	652 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	IFT20	Q8IY31	132 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	APCDD1	Q8J025	514 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	ZNF567	Q8N184	647 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	NAT16	Q8N8M0	369 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	USP33	Q8TEY7	942 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	NXPE3	Q969Y0	559 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	LRRC45	Q96CN5	670 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	SNF8	Q96H20	258 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	PNKP	Q96T60	521 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	HINFP	Q9BQA5	517 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	DPH5	Q9H2P9	285 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	BRD9	Q9H8M2	597 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	GDF3	Q9NR23	364 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	VPS51	Q9UID3	782 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	SNX24	Q9Y343	169 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	NUP205	Q92621	2012 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	TULP3	O75386	442 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	UQCRH	P07919	91 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	CISD3	P0C7P0	127 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	MMP13	P45452	471 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	DGKG	P49619	791 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	RENBP	P51606	427 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	TERF1	P54274	439 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	ARF5	P84085	180 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	CUL1	Q13616	776 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	TRADD	Q15628	312 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	AAK1	Q2M2I8	961 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	MARC1	Q5VT66	337 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	WDR93	Q6P2C0	686 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	AHI1	Q8N157	1196 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	TEX26	Q8N6G2	289 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	CNTD1	Q8N815	330 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	ACD	Q96AP0	544 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	TEKT5	Q96M29	485 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	GBA3	Q9H227	469 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	WHRN	Q9P202	907 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	NDC80	O14777	642 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	TRIM24	O15164	1050 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	NEBL	O76041	1014 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	METTL18	O95568	372 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	CD160	O95971	181 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	HLA-DQB2	P05538	268 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	TUBB	P07437	444 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	IL9	P15248	144 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	NFKB1	P19838	968 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	TNFRSF8	P28908	595 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	GJA4	P35212	333 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	FDFT1	P37268	417 aa		11.61	□□□□□ -0.55
MCF2L-231	ENST00000494043	SLC6A11	P48066	632 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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