RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489537.5

SF3A3-208, Transcript of splicing factor 3a subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene SF3A3, Length 891 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3-208ENST00000489537 ETS1P14921 441 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 CHN1P15882 459 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 RAG1P15918 1043 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 CA4P22748 312 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 MAGEA3P43357 314 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 CCT5P48643 541 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 RABGGTBP53611 331 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 GDF10P55107 478 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 CCL23P55773 120 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 GUCY1A3Q02108 690 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 DSG1Q02413 1049 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 TNK2Q07912 1038 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 CLN3Q13286 438 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 MPP3Q13368 585 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.373e-7■□□□□ 11.1
SF3A3-208ENST00000489537 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 ITIH4Q14624 930 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 SPANXN3Q5MJ09 141 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 STXBP5Q5T5C0 1151 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 STEAP4Q687X5 459 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 NPNTQ6UXI9 565 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 RGS9BPQ6ZS82 235 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 CCDC149Q6ZUS6 474 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 TRABD2AQ86V40 505 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 EXOC3L1Q86VI1 746 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 NLRP14Q86W24 1093 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 HOMEZQ8IX15 550 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 KIRREL3Q8IZU9 778 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 ELMOD1Q8N336 334 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 CALML6Q8TD86 181 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 FBF1Q8TES7 1133 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 HASPINQ8TF76 798 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 SLC44A1Q8WWI5 657 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 MAML1Q92585 1016 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 EDEM1Q92611 657 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 PEX13Q92968 403 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 TOP1MTQ969P6 601 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 SLC39A13Q96H72 371 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 SCLYQ96I15 445 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 IGSF21Q96ID5 467 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 MYRFLQ96LU7 910 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 TEKT5Q96M29 485 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 MAGEB18Q96M61 343 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 CCT8L2Q96SF2 557 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 PAFAH2Q99487 392 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 PAAF1Q9BRP4 392 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 NACA2Q9H009 215 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 VPS11Q9H270 941 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 TRABDQ9H4I3 376 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 FAM96AQ9H5X1 160 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 MKS1Q9NXB0 559 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 COX16Q9P0S2 106 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 RSPH14Q9UHP6 348 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 MID2Q9UJV3 735 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa6.49□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa6.49□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 A0A1W2PQH9 124 aa6.49□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 TMEM120BA0PK00 339 aa6.49□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 EPOPA6NHQ4 379 aa6.49□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 SMIM23A6NLE4 172 aa6.49□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 E9PAM4 449 aa6.49□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 F5H5T6 163 aa6.49□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.49□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 HCRTO43612 131 aa6.49□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 TIMM44O43615 452 aa6.49□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 LPXNO60711 386 aa6.49□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 PAGE1O75459 146 aa6.49□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 CLDN11O75508 207 aa6.49□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 USP1O94782 785 aa6.49□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 TMEM63AO94886 807 aa6.49□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 ABLIM3O94929 683 aa6.49□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 EPOP01588 193 aa6.49□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 CCNB1P14635 433 aa6.49□□□□□ -1.37
SF3A3-208ENST00000489537 PTPN3P26045 913 aa6.49□□□□□ -1.37
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