RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	IL37	Q9NZH6	218 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	FZD10	Q9ULW2	581 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	SCN1A	P35498	2009 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM92A	A1XBS5	289 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	C5orf60	A6NFR6	353 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CLDN5	O00501	218 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	NRP1	O14786	923 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	APOL1	O14791	398 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	GCAT	O75600	419 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	GRAP2	O75791	330 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	BEST1	O76090	585 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	B3GAT3	O94766	335 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	EFEMP2	O95967	443 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	F9	P00740	461 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	SHBG	P04278	402 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	IVL	P07476	585 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CD8B	P10966	210 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CYP2F1	P24903	491 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CYP2C18	P33260	490 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	HTR7	P34969	479 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	MAGEA3	P43357	314 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	MAGEA4	P43358	317 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	MAGEA11	P43364	429 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CXCR3	P49682	368 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	TKTL1	P51854	596 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC18A1	P54219	525 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	BCAR1	P56945	870 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	GPS1	Q13098	491 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	DPYS	Q14117	519 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	KRT81	Q14533	505 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNJ11	Q14654	390 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	LLGL1	Q15334	1064 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	KRT71	Q3SY84	523 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB6C	Q53S08	254 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	DEFB106A	Q8N104	65 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CNPY4	Q8N129	248 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	MFSD4A	Q8N468	514 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	MCU	Q8NE86	351 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	URGCP	Q8TCY9	931 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	HSPH1	Q92598	858 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	P3H4	Q92791	437 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	HAUS1	Q96CS2	278 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	C8orf48	Q96LL4	319 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247		Q96M66	194 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CALN1	Q9BXU9	219 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	PAK5	Q9P286	719 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	KAT6A	Q92794	2004 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	OR6C75	A6NL08	312 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATG4A-208	ENST00000489247	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		5.71	□□□□□ -1.5

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