RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486274.5

TBC1D23-208, Transcript of TBC1 domain family member 23, human

TSL 5

Gene TBC1D23, Length 4,054 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBC1D23-208	ENST00000486274	DCX	O43602	365 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	GLRA3	O75311	464 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	PIGR	P01833	764 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	CHRNA1	P02708	482 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	CCL5	P13501	91 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	CSF2RA	P15509	400 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	PFKP	Q01813	784 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	BCL2L1	Q07817	233 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	FLCN	Q8NFG4	579 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	CASP10	Q92851	521 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	MTBP	Q96DY7	904 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	CATSPER2	Q96P56	530 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	SPG21	Q9NZD8	308 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	COL4A1	P02462	1669 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274		A0A1W2PRU2	124 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	STBD1	O95210	358 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	CSH1	P0DML2	217 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	CSH2	P0DML3	217 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	GLUD2	P49448	558 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZNF460	Q14592	562 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	QPCT	Q16769	361 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZNF567	Q8N184	647 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	ESAM	Q96AP7	390 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	HBEGF	Q99075	208 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	SMO	Q99835	787 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	DRC3	Q9H069	523 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	BTN3A1	O00481	513 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	ANGPT2	O15123	496 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	DAB1	O75553	588 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	FECH	P22830	423 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	RGS4	P49798	205 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	SERPINB8	P50452	374 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	PFKFB4	Q16877	469 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	C17orf99	Q6UX52	265 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	MPP5	Q8N3R9	675 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	ACBD6	Q9BR61	282 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	RRN3	Q9NYV6	651 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	SMAP	O00193	183 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	VPS26A	O75436	327 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	CRTAM	O95727	393 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	IL1B	P01584	269 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	USP4	Q13107	963 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	SEMA5A	Q13591	1074 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	GPR158	Q5T848	1215 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	PEBP4	Q96S96	227 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	SERPINI1	Q99574	410 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	CD248	Q9HCU0	757 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	SEPT3	Q9UH03	358 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	CFAP99	D6REC4	459 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274		E9PAM4	449 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	PGAM1	P18669	254 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	PTGIR	P43119	386 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	RASA2	Q15283	850 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	PTPRN	Q16849	979 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	STRADA	Q7RTN6	431 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	MAGEB18	Q96M61	343 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	CPQ	Q9Y646	472 aa		10.77	□□□□□ -0.68
TBC1D23-208	ENST00000486274	UTRN	P46939	3433 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TBC1D23-208	ENST00000486274	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TBC1D23-208	ENST00000486274	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TBC1D23-208	ENST00000486274	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TBC1D23-208	ENST00000486274	IQCF5	A8MTL0	148 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TBC1D23-208	ENST00000486274	SOCS7	O14512	581 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TBC1D23-208	ENST00000486274	INPP4B	O15327	924 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TBC1D23-208	ENST00000486274	BAIAP3	O94812	1187 aa		10.77	□□□□□ -0.69

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