RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483738.1

UBIAD1-203, Transcript of UbiA prenyltransferase domain containing 1, human

TSL 3

Gene UBIAD1, Length 1,393 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBIAD1-203	ENST00000483738	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		11.03	□□□□□ -0.64
UBIAD1-203	ENST00000483738	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		11.03	□□□□□ -0.64
UBIAD1-203	ENST00000483738	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
UBIAD1-203	ENST00000483738	ERICH1	Q86X53	443 aa		11.03	□□□□□ -0.64
UBIAD1-203	ENST00000483738	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		11.03	□□□□□ -0.64
UBIAD1-203	ENST00000483738	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		11.03	□□□□□ -0.64
UBIAD1-203	ENST00000483738	SPON2	Q9BUD6	331 aa		11.03	□□□□□ -0.64
UBIAD1-203	ENST00000483738	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		11.03	□□□□□ -0.64
UBIAD1-203	ENST00000483738	IL36A	Q9UHA7	158 aa		11.03	□□□□□ -0.64
UBIAD1-203	ENST00000483738	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
UBIAD1-203	ENST00000483738	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		11.03	□□□□□ -0.64
UBIAD1-203	ENST00000483738	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		11.03	□□□□□ -0.64
UBIAD1-203	ENST00000483738	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		11.03	□□□□□ -0.64
UBIAD1-203	ENST00000483738	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738		A0A087WV48	116 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738		A0A1W2PQU0	124 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738		A6NNZ2	444 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	BECN2	A8MW95	431 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	NEMP1	O14524	444 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	WNT9A	O14904	365 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	FFAR2	O15552	330 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	SRC	P12931	536 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	PRLR	P16471	622 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	PON1	P27169	355 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	ETFB	P38117	255 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	NEK3	P51956	506 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	SHB	Q15464	509 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	BROX	Q5VW32	411 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	HORMAD1	Q86X24	394 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	MLKL	Q8NB16	471 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	TMIE	Q8NEW7	156 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	KLK6	Q92876	244 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	C18orf8	Q96DM3	657 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	ABCG4	Q9H172	646 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	VPS51	Q9UID3	782 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	SARDH	Q9UL12	918 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	SNAP91	O60641	907 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	SRGAP2	O75044	1071 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	PTMS	P20962	102 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	RRM1	P23921	792 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	ACP1	P24666	158 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	SCNN1A	P37088	669 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	METAP1	P53582	386 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	UBE2H	P62256	183 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	SLC20A2	Q08357	652 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	KCNMA1	Q12791	1236 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	SGCG	Q13326	291 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	TMC6	Q7Z403	805 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	FEM1C	Q96JP0	617 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	PIGV	Q9NUD9	493 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		11.01	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	SIGLEC6	O43699	453 aa		11	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	CNTN5	O94779	1100 aa		11	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	ENDOD1	O94919	500 aa		11	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	DES	P17661	470 aa		11	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	CXCR3	P49682	368 aa		11	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	IRAK1	P51617	712 aa		11	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	CLDN6	P56747	220 aa		11	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		11	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	ARSI	Q5FYB1	569 aa		11	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		11	□□□□□ -0.65
UBIAD1-203	ENST00000483738	TAF3	Q5VWG9	929 aa		11	□□□□□ -0.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms