RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 UVRAGQ9P2Y5 699 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 SERGEFQ9UGK8 458 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 PILRBQ9UKJ0 227 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 ACTL7AQ9Y615 435 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 MCF2LO15068 1137 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 PSMD8P48556 350 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 BOLA3Q53S33 107 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 TCEAL6Q6IPX3 200 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 CADM4Q8NFZ8 388 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 OR2A12Q8NGT7 310 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 FOXJ1Q92949 421 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 TCEAL3Q969E4 200 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 BTBD1Q9H0C5 482 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 FBXL12Q9NXK8 326 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 SARDHQ9UL12 918 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 PPM1HQ9ULR3 514 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 NUMA1Q14980 2115 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 CHD5Q8TDI0 1954 aa21.39■■□□□ 1.02
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ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PP55 124 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 METTL12A8MUP2 240 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 PATE3B3GLJ2 98 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 RASA4BC9J798 803 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 ALOX15BO15296 676 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 RASA4O43374 803 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 KDELR3O43731 214 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 ADH1BP00325 375 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 IL1BP01584 269 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 RARAP10276 462 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 GOT1P17174 413 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 C5AR1P21730 350 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 DPP6P42658 865 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 HCAR3P49019 387 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 LMNB2Q03252 620 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 C22orf39Q6P5X5 142 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 RFX8Q6ZV50 586 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 AADATQ8N5Z0 425 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 CEP44Q9C0F1 390 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 NEUROG2Q9H2A3 272 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 ZWILCHQ9H900 591 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 SGK2Q9HBY8 427 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 NUP205Q92621 2012 aa21.39■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 BNIP3LO60238 219 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 GDF9O60383 454 aa21.38■■□□□ 1.01
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ACTB-211ENST00000480301 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 METAP1P53582 386 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP8P85298 464 aa21.38■■□□□ 1.01
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ACTB-211ENST00000480301 SMTNL2Q2TAL5 461 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 DCAF12L1Q5VU92 463 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 CPNE8Q86YQ8 564 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 GANCQ8TET4 914 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 TEKT4Q8WW24 435 aa21.38■■□□□ 1.01
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ACTB-211ENST00000480301 KLC2Q9H0B6 622 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 TNKS2Q9H2K2 1166 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 OSGEPQ9NPF4 335 aa21.38■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 RXFP3Q9NSD7 469 aa21.38■■□□□ 1.01
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ACTB-211ENST00000480301 DAPK3O43293 454 aa21.37■■□□□ 1.01
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ACTB-211ENST00000480301 SEMA4FO95754 770 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 ERCC2P18074 760 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 MAOBP27338 520 aa21.37■■□□□ 1.01
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ACTB-211ENST00000480301 HOXD12P35452 270 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 SERINC3Q13530 473 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 PARP15Q460N3 678 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 WDR45BQ5MNZ6 344 aa21.37■■□□□ 1.01
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ACTB-211ENST00000480301 LEKR1Q6ZMV7 388 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 DSG4Q86SJ6 1040 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 HDDC3Q8N4P3 179 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 CHST14Q8NCH0 376 aa21.37■■□□□ 1.01
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ACTB-211ENST00000480301 DNASE2BQ8WZ79 361 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 HSPH1Q92598 858 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 CCDC114Q96M63 670 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 OMDQ99983 421 aa21.37■■□□□ 1.01
ACTB-211ENST00000480301 PCED1AQ9H1Q7 454 aa21.37■■□□□ 1.01
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