RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 ARHGEF26Q96DR7 871 aa20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 PCED1AQ9H1Q7 454 aa20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 MAGEH1Q9H213 219 aa20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 SGK2Q9HBY8 427 aa20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 DNAH14Q0VDD8 3507 aa20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 A0A1W2PP55 124 aa20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 METTL12A8MUP2 240 aa20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 MEI4A8MW99 385 aa20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 MCF2LO15068 1137 aa20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 ALOX15BO15296 676 aa20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 AKR1B10O60218 316 aa20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 BNIP3LO60238 219 aa20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 SEMA4FO95754 770 aa20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 C5AR1P21730 350 aa20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 TPI1P60174 286 aa20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 ARF5P84085 180 aa20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM61Q5EBN2 209 aa20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 CEP76Q8TAP6 659 aa20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 NETO1Q8TDF5 533 aa20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC114Q96M63 670 aa20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 OMDQ99983 421 aa20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 RXFP3Q9NSD7 469 aa20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 ANAPC7Q9UJX3 599 aa20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 HPCAL4Q9UM19 191 aa20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa20.33■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 WASH4PA8MWX3 477 aa20.33■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 CA9Q16790 459 aa20.33■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 DUOXA1Q1HG43 343 aa20.33■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 DCAF12L1Q5VU92 463 aa20.33■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 FAM46CQ5VWP2 391 aa20.33■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 C22orf39Q6P5X5 142 aa20.33■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 RABEPKQ7Z6M1 372 aa20.33■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 DNASE2BQ8WZ79 361 aa20.33■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC42Q96M95 316 aa20.33■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 CHP1Q99653 195 aa20.33■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 DLL3Q9NYJ7 618 aa20.33■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 DONSONQ9NYP3 566 aa20.33■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 SERGEFQ9UGK8 458 aa20.33■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 IP6K2Q9UHH9 426 aa20.33■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 FZD4Q9ULV1 537 aa20.33■□□□□ 0.85
CTPS1-206ENST00000470271 LNP1A1A4G5 178 aa20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 MYO1FO00160 1098 aa20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 GOT1P17174 413 aa20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 MAOBP27338 520 aa20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 IRX4P78413 519 aa20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 SLC23A3Q6PIS1 610 aa20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 HDDC3Q8N4P3 179 aa20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 AADATQ8N5Z0 425 aa20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 NIPA2Q8N8Q9 360 aa20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 OR2A12Q8NGT7 310 aa20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 BTBD6Q96KE9 485 aa20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 EDEM2Q9BV94 578 aa20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 CEP44Q9C0F1 390 aa20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 NEUROG2Q9H2A3 272 aa20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 SUSD2Q9UGT4 822 aa20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 PPM1HQ9ULR3 514 aa20.32■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 KDELR3O43731 214 aa20.31■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 CFIP05156 583 aa20.31■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 H2AFZP0C0S5 128 aa20.31■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 GNSP15586 552 aa20.31■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 LIMK1P53667 647 aa20.31■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 BOLA3Q53S33 107 aa20.31■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 H2AFVQ71UI9 128 aa20.31■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF354CQ86Y25 554 aa20.31■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa20.31■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa20.31■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CTPS1-206ENST00000470271 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.31■□□□□ 0.84
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