RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467246.5

HPS1-208, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HPS1, Length 2,791 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-208ENST00000467246 FCHO1O14526 889 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 PROCP04070 461 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 AQP5P55064 265 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 WLSQ5T9L3 541 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 CRLF3Q8IUI8 442 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 C10orf107Q8IVU9 208 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 LZTR1Q8N653 840 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 AGAP11Q8TF27 550 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 NSMCE1Q8WV22 266 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 C8orf48Q96LL4 319 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 THAP1Q9NVV9 213 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.552e-6■■■□□ 17.4
HPS1-208ENST00000467246 KCNK4Q9NYG8 393 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 FRMPD3Q5JV73 1810 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 HLA-DQB2P05538 268 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 PGGT1BP53609 377 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 SATB1Q01826 763 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 POU6F1Q14863 301 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 DENND5AQ6IQ26 1287 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 LONP2Q86WA8 852 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 TNS4Q8IZW8 715 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 SLC43A3Q8NBI5 491 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 RNF217Q8TC41 542 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 SLC39A13Q96H72 371 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 FCRL5Q96RD9 977 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 FICDQ9BVA6 458 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 ATXN3LQ9H3M9 355 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa11.63□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 NBNO60934 754 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 PMPCBO75439 489 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 PTPN4P29074 926 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 MAGEA12P43365 314 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 RASSF2P50749 326 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 IRF9Q00978 393 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 EFEMP1Q12805 493 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 MPP3Q13368 585 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 GPNMBQ14956 572 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 AFMIDQ63HM1 303 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 LRRC8DQ7L1W4 858 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 LINC00523Q86TU6 105 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 DBF4BQ8NFT6 615 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 MAGEC3Q8TD91 643 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 ISL2Q96A47 359 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 SPDL1Q96EA4 605 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 MIPEPQ99797 713 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 TBL1YQ9BQ87 522 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 KIFC1Q9BW19 673 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 TMEM161AQ9NX61 479 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 COPG2Q9UBF2 871 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 ADAM28Q9UKQ2 775 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 TLR6Q9Y2C9 796 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 A0A096LPK6 155 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 ENPP3O14638 875 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 INHAP05111 366 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 EZRP15311 586 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 HOXD10P28358 340 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 ARRB2P32121 409 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 HTR7P34969 479 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 GCKP35557 465 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 PBX3P40426 434 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 SLC1A6P48664 564 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 SERPINB8P50452 374 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 TBX4P57082 545 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 PSMD5Q16401 504 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 INSCQ1MX18 579 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 MIB1Q86YT6 1006 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 NSL1Q96IY1 281 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 CAPNS2Q96L46 248 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 EBF4Q9BQW3 602 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 MCMBPQ9BTE3 642 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 CRISPLD1Q9H336 500 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 FBXO44Q9H4M3 255 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 SYN3O14994 580 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 ANXA9O76027 345 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 CNTN5O94779 1100 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 ALFQ53S48 1182 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 MSANTD2Q6P1R3 559 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 ABI1Q8IZP0 508 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 FAM13CQ8NE31 585 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 VPS39Q96JC1 886 aa11.62□□□□□ -0.55
HPS1-208ENST00000467246 C1orf74Q96LT6 269 aa11.62□□□□□ -0.55
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