RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 RASA4BC9J798 803 aa21.88■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 K7ERQ8 282 aa21.88■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 RASA4O43374 803 aa21.88■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 KDELR3O43731 214 aa21.88■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 ZMPSTE24O75844 475 aa21.88■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 IL1BP01584 269 aa21.88■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 GJC1P36383 396 aa21.88■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 ARHGAP25P42331 645 aa21.88■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 SPEM2Q0P670 501 aa21.88■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 KRT81Q14533 505 aa21.88■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 CST6Q15828 149 aa21.88■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 DPYSL2Q16555 572 aa21.88■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 PARP15Q460N3 678 aa21.88■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 ARMCX6Q7L4S7 300 aa21.88■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa21.88■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa21.88■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa21.88■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 NUP205Q92621 2012 aa21.88■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 GON4LQ3T8J9 2241 aa21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 CHD5Q8TDI0 1954 aa21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 DMDP11532 3685 aa21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 CEP192Q8TEP8 1941 aa21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 MCF2LO15068 1137 aa21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 LRP3O75074 770 aa21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 ADH1BP00325 375 aa21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 IGLV3-19P01714 112 aa21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 ERCC2P18074 760 aa21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 SLC8A1P32418 973 aa21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 MAN1A1P33908 653 aa21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 PSMD8P48556 350 aa21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 NDST2P52849 883 aa21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 ARF5P84085 180 aa21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 FAM46CQ5VWP2 391 aa21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 LYSMD4Q5XG99 296 aa21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 CYP2U1Q7Z449 544 aa21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 OMDQ99983 421 aa21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 GPR174Q9BXC1 333 aa21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 SOWAHDA6NJG2 315 aa21.86■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 ALOX15BO15296 676 aa21.86■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 MID1O15344 667 aa21.86■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 BUB1O43683 1085 aa21.86■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 LCA5LO95447 670 aa21.86■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 C7P10643 843 aa21.86■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 C5AR1P21730 350 aa21.86■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 NOP2P46087 812 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 DNA2P51530 1060 aa21.86■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 CDH6P55285 790 aa21.86■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 C22orf39Q6P5X5 142 aa21.86■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 USP30Q70CQ3 517 aa21.86■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 KIAA2013Q8IYS2 634 aa21.86■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 FOXJ1Q92949 421 aa21.86■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 HMCESQ96FZ2 354 aa21.86■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 CEP44Q9C0F1 390 aa21.86■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 BTBD1Q9H0C5 482 aa21.86■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 FBXL12Q9NXK8 326 aa21.86■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 ARHGAP42A6NI28 874 aa21.85■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa21.85■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 MTA2O94776 668 aa21.85■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 NDUFA10O95299 355 aa21.85■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 KRT7P08729 469 aa21.85■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 FECHP22830 423 aa21.85■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 MPLP40238 635 aa21.85■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 PTGER3P43115 390 aa21.85■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF33AQ06730 810 aa21.85■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 SERINC3Q13530 473 aa21.85■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 POLNQ7Z5Q5 900 aa21.85■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 HDDC3Q8N4P3 179 aa21.85■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 LZTR1Q8N653 840 aa21.85■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 KCTD6Q8NC69 237 aa21.85■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 PIGKQ92643 395 aa21.85■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 TNKS2Q9H2K2 1166 aa21.85■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 SGK2Q9HBY8 427 aa21.85■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 PCDH18Q9HCL0 1135 aa21.85■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 SEMA4GQ9NTN9 838 aa21.85■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 A0A1W2PP55 124 aa21.84■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 AMPD1P23109 780 aa21.84■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 CHRNA3P32297 505 aa21.84■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 DPP6P42658 865 aa21.84■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 DPYSQ14117 519 aa21.84■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 TCEAL1Q15170 157 aa21.84■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 CCDC6Q16204 474 aa21.84■■□□□ 1.09
ABCD4-202ENST00000460308 SYCP2LQ5T4T6 812 aa21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms