RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ALOX15BO15296 676 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZMPSTE24O75844 475 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACVRL1P37023 503 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAPKAPK2P49137 400 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CLCN6P51797 869 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARF5P84085 180 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BNC1Q01954 994 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SEMA3BQ13214 749 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 POM121L1PQ3SYA9 428 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EFHC2Q5JST6 749 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM46CQ5VWP2 391 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C22orf39Q6P5X5 142 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PYROXD2Q8N2H3 581 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DEFB124Q8NES8 71 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR2A12Q8NGT7 310 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ORAI3Q9BRQ5 295 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RETREG1Q9H6L5 497 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PARVAQ9NVD7 372 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM248Q9NWD8 314 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPM1HQ9ULR3 514 aa15.92■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A0A1B0GVT2 93 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A0A1W2PQJ5 194 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C10orf142B7Z368 130 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GJB3O75712 270 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FTLP02792 175 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CTSLP07711 333 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GZMAP12544 262 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RETSATQ6NUM9 610 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LAYNQ6UX15 382 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMC6Q7Z403 805 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PIP4P1Q86T03 277 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM131CQ96AQ9 280 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCDC114Q96M63 670 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TNKS2Q9H2K2 1166 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OSGEPQ9NPF4 335 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FZD10Q9ULW2 581 aa15.91■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A0A1W2PPC4 97 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UPK3BL1B0FP48 263 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UPK3BL2E5RIL1 263 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RTN2O75298 545 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CEACAM1P13688 526 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CD59P13987 128 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DESP17661 470 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PSMA2P25787 234 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 L1CAMP32004 1257 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CHRNA3P32297 505 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ETFBP38117 255 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC20A2Q08357 652 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CNTN1Q12860 1018 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AGBL4Q5VU57 503 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HGSNATQ68CP4 663 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CHST14Q8NCH0 376 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC6A18Q96N87 628 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC32A1Q9H598 525 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EBF2Q9HAK2 575 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IL21RQ9HBE5 538 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IFNKQ9P0W0 207 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACTL7AQ9Y615 435 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLXNA2O75051 1894 aa15.9■□□□□ 0.14
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TBC1D3EA0A087X179 549 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TBC1D3LB9A6J9 549 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC7A4O43246 635 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CREB3O43889 395 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RAMP2O60895 175 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CER1O95813 267 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CD160O95971 181 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TBC1D3HP0C7X1 549 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EPHB2P29323 1055 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GRIA4P48058 902 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCR5P51681 352 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AIF1P55008 147 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPP2CBP62714 309 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPP2CAP67775 309 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC14A1Q13336 389 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TEAD4Q15561 434 aa15.89■□□□□ 0.13
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KIF19Q2TAC6 998 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.1 ms