RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455020.2

SPDYE2B-202, Transcript of speedy/RINGO cell cycle regulator family member E2B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPDYE2B, Length 1,219 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE2B-202ENST00000455020 TNFSF15O95150 251 aa20.31■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 IGLV3-25P01717 112 aa20.31■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 NME1P15531 152 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 FZD2Q14332 565 aa20.31■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 Q6ZSR6 202 aa20.31■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 BTN2A3PQ96KV6 586 aa20.31■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 HSFY1Q96LI6 401 aa20.31■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 STARD5Q9NSY2 213 aa20.31■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 EVA1BQ9NVM1 165 aa20.31■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 SLC25A13Q9UJS0 675 aa20.31■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 A6NNZ2 444 aa20.3■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 STX10O60499 249 aa20.3■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 MYL1P05976 194 aa20.3■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 PAEPP09466 180 aa20.3■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 ZNF18P17022 549 aa20.3■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 FGL2Q14314 439 aa20.3■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 DEFB133Q30KQ1 61 aa20.3■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.3■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 TMEM259Q4ZIN3 620 aa20.3■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 TPRG1LQ5T0D9 272 aa20.3■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 TCERG1LQ5VWI1 586 aa20.3■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 NEK5Q6P3R8 708 aa20.3■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 SH2D3CQ8N5H7 860 aa20.3■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 KAT5Q92993 513 aa20.3■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 BMFQ96LC9 184 aa20.3■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 KIAA1257Q9ULG3 409 aa20.3■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 OR51B4Q9Y5P0 310 aa20.3■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 POM121BA6NF01 834 aa20.29■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 RAD51BO15315 384 aa20.29■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 CSF2P04141 144 aa20.29■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 ITGB6P18564 788 aa20.29■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 DPYDQ12882 1025 aa20.29■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 CNGA2Q16280 664 aa20.29■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 ARL14Q8N4G2 192 aa20.29■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 EXTL1Q92935 676 aa20.29■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 GRAMD1AQ96CP6 724 aa20.29■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 HPSEQ9Y251 543 aa20.29■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 MT-CO1P00395 513 aa20.28■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 ITGA2BP08514 1039 aa20.28■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 SRCP12931 536 aa20.28■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 GGCXP38435 758 aa20.28■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 RPL34P49207 117 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 NUCB2P80303 420 aa20.28■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 FBXL22Q6P050 247 aa20.28■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 ATG14Q6ZNE5 492 aa20.28■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 PARGQ86W56 976 aa20.28■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 CHST14Q8NCH0 376 aa20.28■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 OR2A12Q8NGT7 310 aa20.28■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 FEM1AQ9BSK4 669 aa20.28■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 WDR70Q9NW82 654 aa20.28■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa20.28■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 CCDC187A0A096LP49 1063 aa20.27■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa20.27■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 KCNU1A8MYU2 1149 aa20.27■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 MUSKO15146 869 aa20.27■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 AQP9O43315 295 aa20.27■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 SUV39H1O43463 412 aa20.27■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 TCEA3O75764 348 aa20.27■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 PCDH8O95206 1070 aa20.27■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 F13A1P00488 732 aa20.27■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 FAM87AP0C7U9 286 aa20.27■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 CHRNA3P32297 505 aa20.27■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 TGIF1Q15583 401 aa20.27■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 SLC35F3Q8IY50 421 aa20.27■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa20.27■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 VPS28Q9UK41 221 aa20.27■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 HS3ST2Q9Y278 367 aa20.27■□□□□ 0.84
SPDYE2B-202ENST00000455020 K7ERQ8 282 aa20.26■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 SPINT1O43278 529 aa20.26■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 NOBOXO60393 691 aa20.26■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 SNAP91O60641 907 aa20.26■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 NR0B2Q15466 257 aa20.26■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 RABGAP1LQ5R372 815 aa20.26■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 BEND5Q7L4P6 421 aa20.26■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa20.26■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 RBFAQ8N0V3 343 aa20.26■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa20.26■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 LMX1AQ8TE12 382 aa20.26■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 PSMB7Q99436 277 aa20.26■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa20.26■□□□□ 0.83
SPDYE2B-202ENST00000455020 ST7Q9NRC1 585 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms