RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446688.5

TNS1-209, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 4,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-209ENST00000446688 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 EBF3Q9H4W6 596 aa10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 SQORQ9Y6N5 450 aa10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 B4GALT5O43286 388 aa10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 TBC1D4O60343 1298 aa10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 CABYRO75952 493 aa10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 VAPBO95292 243 aa10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 SOAT1P35610 550 aa10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 IKBKEQ14164 716 aa10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 ACAP1Q15027 740 aa10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 CES3Q6UWW8 571 aa10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 PIGZQ86VD9 579 aa10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 UNC93AQ86WB7 457 aa10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 OOSP2Q86WS3 158 aa10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 OSBPL11Q9BXB4 747 aa10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 COPG2Q9UBF2 871 aa10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 RABGEF1Q9UJ41 708 aa10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 CLUHO75153 1309 aa10.15□□□□□ -0.78
TNS1-209ENST00000446688 A0A0B4J269 797 aa10.15□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa10.15□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 RBP1P09455 135 aa10.15□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 RBL1P28749 1068 aa10.15□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 NOS2P35228 1153 aa10.15□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 FLT3LGP49771 235 aa10.15□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 DAB2P98082 770 aa10.15□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 DMC1Q14565 340 aa10.15□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 UGCGQ16739 394 aa10.15□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 TREML2Q5T2D2 321 aa10.15□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ARMC3Q5W041 872 aa10.15□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 POLNQ7Z5Q5 900 aa10.15□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 WNT8BQ93098 351 aa10.15□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 BORCS5Q969J3 196 aa10.15□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 CLPTM1LQ96KA5 538 aa10.15□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 RNPEPQ9H4A4 650 aa10.15□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PNPLA3Q9NST1 481 aa10.15□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 TBC1D13Q9NVG8 400 aa10.15□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 EFR3BQ9Y2G0 817 aa10.15□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PLLPQ9Y342 182 aa10.15□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 CAPN8A6NHC0 703 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 TOMM70O94826 608 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 BPGMP07738 259 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 GP5P40197 560 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ABL2P42684 1182 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 BANPQ8N9N5 519 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 MAGED4Q96JG8 741 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 KREMEN1Q96MU8 473 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PREBQ9HCU5 417 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 RGSL1A5PLK6 1076 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 SAC3D1A6NKF1 404 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 LGR5O75473 907 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 CCNFP41002 786 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 CD151P48509 253 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 USP4Q13107 963 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 TCEAL1Q15170 157 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 INAQ16352 499 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 RGS21Q2M5E4 152 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 CHADLQ6NUI6 762 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 SATL1Q86VE3 508 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 CACUL1Q86Y37 369 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 RELL1Q8IUW5 271 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 C1orf50Q9BV19 199 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ACTR8Q9H981 624 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PARVBQ9HBI1 364 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 DMAC2Q9NW81 257 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 GMEB1Q9Y692 573 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 PCDH8O95206 1070 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 MPOP05164 745 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 CKBP12277 381 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 ITGB6P18564 788 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 KDELR1P24390 212 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 MGAT1P26572 445 aa10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
TNS1-209ENST00000446688 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms