RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 ITIH5Q86UX2 942 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 RCOR2Q8IZ40 523 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CLIP4Q8N3C7 705 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 RSAD2Q8WXG1 361 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 IFT52Q9Y366 437 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR81Q562E7 1941 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 LCTP09848 1927 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM64A6NGJ6 449 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM64BA6NI03 449 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ADM5C9JUS6 153 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 MUSKO15146 869 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CHMP2AO43633 222 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 EGFRP00533 1210 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 HLA-DOAP06340 250 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 DCKP27707 260 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 IDUAP35475 653 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 GRIA3P42263 894 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 NR4A2P43354 598 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 VEGFBP49765 207 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ENPEPQ07075 957 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 DNASE1L3Q13609 305 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CEP55Q53EZ4 464 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 PIGGQ5H8A4 983 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 MTX3Q5HYI7 312 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 MBLAC2Q68D91 279 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf186Q6ZWK4 172 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 DSG4Q86SJ6 1040 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 KYQ8NBH2 561 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 LILRB4Q8NHJ6 448 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ACTL9Q8TC94 416 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 AGR3Q8TD06 166 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 MROQ9BYG7 248 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF38Q9H0F5 515 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SNX13Q9Y5W8 968 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM25EA8MYX2 175 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 USP17L10C9JJH3 530 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SNAP91O60641 907 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SPAG6O75602 509 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 BCL10O95999 233 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CAPNS1P04632 268 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CKMT2P17540 419 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 GALNT2Q10471 571 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM47CQ5HY64 1035 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNT2Q6UVM3 1135 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 C16orf89Q6UX73 402 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ARCQ7LC44 396 aa8.54□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 ADGRF2Q8IZF7 708 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 OR7G1Q8NGA0 311 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP1R36Q96LQ0 422 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 MEIS2O14770 477 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CFHP08603 1231 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CCNA2P20248 432 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ME2P23368 584 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 DSG3P32926 999 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 DPP6P42658 865 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SEPHS1P49903 392 aa8.54□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 MAMLD1Q13495 774 aa8.54□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 NIPA1Q7RTP0 329 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAM32Q8TC27 787 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 POMGNT1Q8WZA1 660 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 DLG3Q92796 817 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 RCN3Q96D15 328 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM84AQ96KN4 292 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM20AQ96MK3 541 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 NT5C1BQ96P26 610 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 DOK1Q99704 481 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 PSD2Q9BQI7 771 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 PI4K2AQ9BTU6 479 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD60Q9BZ19 345 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 GPRC5CQ9NQ84 441 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJC28Q9NX36 388 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 MOSPD1Q9UJG1 213 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa8.54□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 PLXNB2O15031 1838 aa8.54□□□□□ -1.04
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