RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438141.5

TTLL3-215, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTLL3, Length 1,743 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-215ENST00000438141 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 GRAMD1AQ96CP6 724 aa13.32□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 TBL1YQ9BQ87 522 aa13.32□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 KIFC1Q9BW19 673 aa13.32□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa13.32□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa13.32□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 DNMT3LQ9UJW3 386 aa13.32□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 YIPF1Q9Y548 306 aa13.32□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 J3KR12 359 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 COPEO14579 308 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 ATP9BO43861 1147 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 GJB5O95377 273 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 ERVK-10P10266 1014 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 CSF2RAP15509 400 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 LAG3P18627 525 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 TACR2P21452 398 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 MAPKAPK2P49137 400 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 LBX1P52954 281 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 GEMP55040 296 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 RAB33AQ14088 237 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 SPRED3Q2MJR0 410 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 RASSF3Q86WH2 238 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 CNPY4Q8N129 248 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 ANKS4BQ8N8V4 417 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 LRRC8CQ8TDW0 803 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 MFSD3Q96ES6 412 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 TMEM169Q96HH4 297 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 FAM111AQ96PZ2 611 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 PITPNM3Q9BZ71 974 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 C11orf49Q9H6J7 331 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 PLLPQ9Y342 182 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 STARD13Q9Y3M8 1113 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 OBSL1O75147 1896 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 MIA3Q5JRA6 1907 aa13.31□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 KIAA0355O15063 1070 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 COCHO43405 550 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 ACSL4O60488 711 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 KIAA0754O94854 1291 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 TPH1P17752 444 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 SLC6A4P31645 630 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 GP5P40197 560 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP13.3□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 58.2
TTLL3-215ENST00000438141 PARP15Q460N3 678 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 HECTD3Q5T447 861 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 KDELC1Q6UW63 502 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 RANBP10Q6VN20 620 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 FAM47EQ6ZV65 393 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 IPMKQ8NFU5 416 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 PTPRN2Q92932 1015 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 ISL2Q96A47 359 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 MRGPRX2Q96LB1 330 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 CPNE1Q99829 537 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 MCMBPQ9BTE3 642 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 SLC25A51Q9H1U9 297 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 CHRAC1Q9NRG0 131 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 ZFATQ9P243 1243 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 PHTF1Q9UMS5 762 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 CCT8L1PA6NM43 557 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 RAMP2O60895 175 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 EFCAB14O75071 495 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 ITGA2BP08514 1039 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 NMBRP28336 390 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 CRHR1P34998 444 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 RENBPP51606 427 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 SLC10A7Q0GE19 358 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 SERINC3Q13530 473 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 IHHQ14623 411 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 FAM117BQ6P1L5 589 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 OTUD6BQ8N6M0 293 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 ACMSDQ8TDX5 336 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 PSMG2Q969U7 264 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 TADA1Q96BN2 335 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 ZNF778Q96MU6 729 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 FICDQ9BVA6 458 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 KDM4CQ9H3R0 1056 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 CYP4F11Q9HBI6 524 aa13.3□□□□□ -0.28
TTLL3-215ENST00000438141 ATP13A1Q9HD20 1204 aa13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms