RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 ADAM28Q9UKQ2 775 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 CLCA2Q9UQC9 943 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 PIPSLA2A3N6 862 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 WDR27A2RRH5 827 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 DIRC3C9JPN6 131 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 E9PAM4 449 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 HIP1O00291 1037 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 FGAP02671 866 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 CD59P13987 128 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 ADSSP30520 456 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 HSPA4P34932 840 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 OR1D2P34982 312 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 PTH2RP49190 550 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 NT5C2P49902 561 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 NRG3P56975 720 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 TP53BP2Q13625 1128 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 TERF2Q15554 542 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 ALX1Q15699 326 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 DUOXA1Q1HG43 343 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 PRR16Q569H4 304 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 FAM171A1Q5VUB5 890 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 RABEPKQ7Z6M1 372 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 NAXDQ8IW45 347 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 HACE1Q8IYU2 909 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 MINDY1Q8N5J2 469 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
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PTPRK-211ENST00000429595 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 FAM167AQ96KS9 214 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 COQ10AQ96MF6 247 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 UBAC1Q9BSL1 405 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 PI4K2AQ9BTU6 479 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 ANO3Q9BYT9 981 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 GRPEL1Q9HAV7 217 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 GTSE1Q9NYZ3 720 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 PRSS50Q9UI38 385 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
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PTPRK-211ENST00000429595 A0A087WZ62 844 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 MBD3O95983 291 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 SERPINF2P08697 491 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 MYL4P12829 197 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 AVPR1BP47901 424 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 GUCY1B3Q02153 619 aa6.73□□□□□ -1.33
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PTPRK-211ENST00000429595 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
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PTPRK-211ENST00000429595 LY6DQ14210 128 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 DMC1Q14565 340 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 BROXQ5VW32 411 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 LYSMD4Q5XG99 296 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 SYT13Q7L8C5 426 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 FMNL3Q8IVF7 1028 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 RUFY2Q8WXA3 655 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 MXRA8Q9BRK3 442 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 LMBRD1Q9NUN5 540 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 F5P12259 2224 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 PCNX2A6NKB5 2137 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 ARL5CA6NH57 179 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 B5MCH6 92 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 F8W810 466 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF213O14771 459 aa6.72□□□□□ -1.33
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PTPRK-211ENST00000429595 HKR1P10072 659 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 CD38P28907 300 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 HOXD12P35452 270 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 FBXO43Q4G163 708 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC157Q569K6 752 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF410Q86VK4 478 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 LEMD2Q8NC56 503 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC26Q8TAB7 109 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 NXPE2Q96DL1 559 aa6.72□□□□□ -1.33
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