RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 LIG3P49916 1009 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC18A1P54219 525 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 PDK4Q16654 411 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ALFQ53S48 1182 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 MS4A13Q5J8X5 152 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 MANEALQ5VSG8 457 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 RAP1GAP2Q684P5 730 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 KDELC2Q7Z4H8 507 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CDKL2Q92772 493 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 TTC17Q96AE7 1141 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 C1orf74Q96LT6 269 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 TSGA13Q96PP4 275 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM111AQ96PZ2 611 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CLIC5Q9NZA1 410 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 GGA2Q9UJY4 613 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM92AA1XBS5 289 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC38A8A6NNN8 435 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 MATN3O15232 486 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 TM9SF1O15321 606 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SUN1O94901 812 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 PARNO95453 639 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ATF6P18850 670 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 HOXC13P31276 330 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 HTR7P34969 479 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC18A2Q05940 514 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SMARCB1Q12824 385 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 COL19A1Q14993 1142 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 STEAP4Q687X5 459 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 KCTD11Q693B1 232 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 FBXL22Q6P050 247 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SH2D5Q6ZV89 423 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SPATA21Q7Z572 469 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CHSY1Q86X52 802 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CCNJLQ8IV13 435 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 NDUFAF2Q8N183 169 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 IPMKQ8NFU5 416 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 DPF3Q92784 378 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 IGSF8Q969P0 613 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 MFSD3Q96ES6 412 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 IGSF21Q96ID5 467 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 APOPT1Q96IL0 206 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 BTN2A3PQ96KV6 586 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SPATA17Q96L03 361 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
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LRRTM4-201ENST00000409088 CWH43Q9H720 699 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC40Q9H9A6 602 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 GLOD4Q9HC38 313 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CASS4Q9NQ75 786 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CHRAC1Q9NRG0 131 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 PCMTD2Q9NV79 361 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ZFATQ9P243 1243 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 TXNDC16Q9P2K2 825 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 EGFL7Q9UHF1 273 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF180Q9UJW8 692 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 PHTF1Q9UMS5 762 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 HRH3Q9Y5N1 445 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 PSAT1Q9Y617 370 aa4.06□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 NLRC5Q86WI3 1866 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 VWA8A3KMH1 1905 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SCN5AQ14524 2016 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 HMX2A2RU54 273 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CCT8L1PA6NM43 557 aa4.05□□□□□ -1.76
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LRRTM4-201ENST00000409088 PMPCBO75439 489 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 RFPL1O75677 317 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ALDH1A2O94788 518 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 F7P08709 466 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 GPC1P35052 558 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 TUFMP49411 452 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SERPINB9P50453 376 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNQ1P51787 676 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 PDE1BQ01064 536 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF33AQ06730 810 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 ITKQ08881 620 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 MGAT5Q09328 741 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 CDH17Q12864 832 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 TAF12Q16514 161 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 SPRED3Q2MJR0 410 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa4.05□□□□□ -1.76
LRRTM4-201ENST00000409088 PLA2G2CQ5R387 149 aa4.05□□□□□ -1.76
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