RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 FNBP1LQ5T0N5 605 aa10□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 KCTD11Q693B1 232 aa10□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa10□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 Q6ZNB5 142 aa10□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 GAREM2Q75VX8 874 aa10□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 DENND1CQ8IV53 801 aa10□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 BBS5Q8N3I7 341 aa10□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 ATXN3LQ9H3M9 355 aa10□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 TASP1Q9H6P5 420 aa10□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa10□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 VPS45Q9NRW7 570 aa10□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 MPP6Q9NZW5 540 aa10□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 SEPT10Q9P0V9 454 aa10□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 RSPH14Q9UHP6 348 aa10□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 LGALS13Q9UHV8 139 aa10□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa10□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa10□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 E2F8A0AVK6 867 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 SPDYE4A6NLX3 237 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 KCNK1O00180 336 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 GREM1O60565 184 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 PRAMEF11O60813 436 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 NEBLO76041 1014 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 CNTN5O94779 1100 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 ACSL3O95573 720 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 KLKB1P03952 638 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 SPATA31D3P0C874 917 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 PSMB4P28070 264 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 STX2P32856 288 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 GNA12Q03113 381 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 MPP3Q13368 585 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 BBS9Q3SYG4 887 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 MARC1Q5VT66 337 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 TAOK1Q7L7X3 1001 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 TP53INP2Q8IXH6 220 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 FBXO36Q8NEA4 188 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 FAM76AQ8TAV0 307 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 PPP2R3CQ969Q6 453 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 TLCD1Q96CP7 247 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 C9orf72Q96LT7 481 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 SLC25A51Q9H1U9 297 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 SP110Q9HB58 689 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 GLOD4Q9HC38 313 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 TRPC7Q9HCX4 862 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 MAN1C1Q9NR34 630 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 GKN1Q9NS71 199 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 ACTL7BQ9Y614 415 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 CACNA1BQ00975 2339 aa9.99□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 GOLGA8MH3BSY2 632 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 KDELR3O43731 214 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 PEX11BO96011 259 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 SHBGP04278 402 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 IL9P15248 144 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 SLC6A4P31645 630 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 CD68P34810 354 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 ELK3P41970 407 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 PTPN5P54829 565 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 NRLP54845 237 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 ZBTB17Q13105 803 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 NAB1Q13506 487 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 SLC12A1Q13621 1099 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 DUSP6Q16828 381 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 MPPE1Q53F39 396 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 RNF43Q68DV7 783 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 TXNDC8Q6A555 127 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 CNTD1Q8N815 330 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 OR2W6PQ8NHA6 318 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 ARL8AQ96BM9 186 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 OTUB2Q96DC9 234 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 HMCESQ96FZ2 354 aa9.98□□□□□ -0.81
POLR1A-202ENST00000409024 SIGLEC10Q96LC7 697 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms