RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 TNKS2Q9H2K2 1166 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SEMA4AQ9H3S1 761 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 GOLPH3Q9H4A6 298 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SMOC1Q9H4F8 434 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ZWILCHQ9H900 591 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 EBF2Q9HAK2 575 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PDFQ9HBH1 243 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PCDH18Q9HCL0 1135 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 FSCN3Q9NQT6 498 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 KLHL11Q9NVR0 708 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM51Q9NW97 253 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 UVRAGQ9P2Y5 699 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SUN2Q9UH99 717 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 IP6K2Q9UHH9 426 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 VPS28Q9UK41 221 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PPM1HQ9ULR3 514 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PLA2G4CQ9UP65 541 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 HS3ST2Q9Y278 367 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 HYOU1Q9Y4L1 999 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 WASF2Q9Y6W5 498 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 DUSP10Q9Y6W6 482 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM131Q92545 1883 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CEP250Q9BV73 2442 aa3.55□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 A0A1W2PP55 124 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 METTL12A8MUP2 240 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 MYO1FO00160 1098 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CBX4O00257 560 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 WNT9AO14904 365 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 MCF2LO15068 1137 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 MUSKO15146 869 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SPINT1O43278 529 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PRPSAP2O60256 369 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 GDF9O60383 454 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 RAMP2O60895 175 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 GJB3O75712 270 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 RNF8O76064 485 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 NDUFA10O95299 355 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 MOCS3O95396 460 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PEX11BO96011 259 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 RETP07949 1114 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TPM1P09493 284 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ITIH2P19823 946 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 COMTP21964 271 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ITPKAP23677 461 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 KDELR1P24390 212 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CD6P30203 668 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CHRNA3P32297 505 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SLC8A1P32418 973 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 MAN1A1P33908 653 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 RGRP47804 291 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PSMD8P48556 350 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 MARCKSL1P49006 195 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 HCAR3P49019 387 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 HADHBP55084 474 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 OXCT1P55809 520 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TAS2R38P59533 333 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TPI1P60174 286 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 KRT83P78385 493 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 BNC1Q01954 994 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SULT2A1Q06520 285 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF33AQ06730 810 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ADCY2Q08462 1091 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CNTN1Q12860 1018 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SERINC3Q13530 473 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 DPYSL3Q14195 570 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 IHHQ14623 411 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 STARD3Q14849 445 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 CST6Q15828 149 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TAZQ16635 292 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 POM121L1PQ3SYA9 428 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ACCSLQ4AC99 568 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 ARSIQ5FYB1 569 aa3.54□□□□□ -1.84
SNORD17-201ENST00000390930 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms