RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384143.1

RNU6-398P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 398, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-398P, Length 109 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-398P-201ENST00000384143 SEL1LQ9UBV2 794 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 TJP2Q9UDY2 1190 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 GGA2Q9UJY4 613 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 PLA2G4CQ9UP65 541 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF510Q9Y2H8 683 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 CKAP5Q14008 2032 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 COL12A1Q99715 3063 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC12A8A0AV02 714 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 FRMD3A2A2Y4 597 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 BLACEA4D250 179 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 LRRC72A6NJI9 287 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 FAM200BP0CF97 657 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 RALAP11233 206 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 IDEP14735 1019 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 GAP43P17677 238 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 TNNI1P19237 187 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 TGM2P21980 687 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC8A1P32418 973 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 CD70P32970 193 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 PSMD8P48556 350 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 KIF11P52732 1056 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 NDST1P52848 882 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 PDX1P52945 283 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 ASIC1P78348 528 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 COG7P83436 770 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 NOTCH2Q04721 2471 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 CYP24A1Q07973 514 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 PDE4CQ08493 712 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 SERINC3Q13530 473 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 PSMD6Q15008 389 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 SURF1Q15526 300 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 TGIF1Q15583 401 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 IGFBP7Q16270 282 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF699Q32M78 642 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 POM121L1PQ3SYA9 428 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 MPPE1Q53F39 396 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC45A4Q5BKX6 768 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 RILPL1Q5EBL4 403 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 C9orf64Q5T6V5 341 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 CCDC186Q7Z3E2 898 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF438Q7Z4V0 828 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 VN1R5Q7Z5H4 357 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 CLEC14AQ86T13 490 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 AHI1Q8N157 1196 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF276Q8N554 614 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 MFSD2AQ8NA29 543 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 OR14C36Q8NHC7 312 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 IFI44Q8TCB0 444 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 MAPK15Q8TD08 544 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 PLEKHO2Q8TD55 490 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 HPS3Q969F9 1004 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 ARRDC3Q96B67 414 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 CCDC127Q96BQ5 260 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 EPSTI1Q96J88 318 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 MRGPRX3Q96LB0 322 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 TWNKQ96RR1 684 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 DCLK3Q9C098 648 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 EPN3Q9H201 632 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 MARCH2Q9P0N8 246 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 SUN2Q9UH99 717 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 ADGRE2Q9UHX3 823 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 FZD4Q9ULV1 537 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 SCML1Q9UN30 329 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 HIF3AQ9Y2N7 669 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 KIF3AQ9Y496 699 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 MYO9AB2RTY4 2548 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 BSNQ9UPA5 3926 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 RELNP78509 3460 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 PLXNA2O75051 1894 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 MYLKQ15746 1914 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 TTC34A8MYJ7 566 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 TGFB1I1O43294 461 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 NOBOXO60393 691 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 RTN2O75298 545 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 PIAS2O75928 621 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 NEBLO76041 1014 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 TNFSF15O95150 251 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 TIAF1O95411 115 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 VNN1O95497 513 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 DLGAP3O95886 979 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 WNT11O96014 354 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-398P-201ENST00000384143 GP1BAP07359 652 aa4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms