RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 SCNM1Q9BWG6 230 aa3.16□□□□□ -1.9
SNORD3E-201ENST00000362899 HDHD5Q9BXW7 423 aa3.16□□□□□ -1.9
SNORD3E-201ENST00000362899 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP3.16□□□□□ -1.9
SNORD3E-201ENST00000362899 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
SNORD3E-201ENST00000362899 ACAD9Q9H845 621 aa3.16□□□□□ -1.9
SNORD3E-201ENST00000362899 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
SNORD3E-201ENST00000362899 RMI1Q9H9A7 625 aa3.16□□□□□ -1.9
SNORD3E-201ENST00000362899 VEZTQ9HBM0 779 aa3.16□□□□□ -1.9
SNORD3E-201ENST00000362899 WASH6PQ9NQA3 447 aa3.16□□□□□ -1.9
SNORD3E-201ENST00000362899 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa3.16□□□□□ -1.9
SNORD3E-201ENST00000362899 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
SNORD3E-201ENST00000362899 PDP2Q9P2J9 529 aa3.16□□□□□ -1.9
SNORD3E-201ENST00000362899 FBXO40Q9UH90 709 aa3.16□□□□□ -1.9
SNORD3E-201ENST00000362899 PGAP2Q9UHJ9 254 aa3.16□□□□□ -1.9
SNORD3E-201ENST00000362899 GJD2Q9UKL4 321 aa3.16□□□□□ -1.9
SNORD3E-201ENST00000362899 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa3.16□□□□□ -1.9
SNORD3E-201ENST00000362899 DTX4Q9Y2E6 619 aa3.16□□□□□ -1.9
SNORD3E-201ENST00000362899 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
SNORD3E-201ENST00000362899 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 OR6C68A6NDL8 312 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM90A10PA6NDY2 464 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 CXorf65A6NEN9 183 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 H3BNX3 289 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 CBX6O95503 412 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 SYF2O95926 243 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 TOMM40O96008 361 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 IL1AP01583 271 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 POLBP06746 335 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 MMP3P08254 477 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 FGF2P09038 288 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 SCP2P22307 547 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 CCKARP32238 428 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 PAFAH1B1P43034 410 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 CLCNKBP51801 687 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 GAD2Q05329 585 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 MTX1Q13505 466 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 NAA25Q14CX7 972 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 NFIL3Q16649 462 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 LRRC24Q50LG9 513 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 C6orf10Q5SRN2 563 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 NCAPH2Q6IBW4 605 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 CAMK1DQ8IU85 385 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 TCP11L2Q8N4U5 519 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 ESX1Q8N693 406 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 TEX19Q8NA77 164 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 DNAAF1Q8NEP3 725 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 MASTLQ96GX5 879 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 TRMOQ9BU70 441 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 MROH8Q9H579 483 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 JMJD4Q9H9V9 463 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 TXNRD2Q9NNW7 524 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 POT1Q9NUX5 634 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 SAGE1Q9NXZ1 904 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 UPB1Q9UBR1 384 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 CNPY2Q9Y2B0 182 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 SQORQ9Y6N5 450 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa3.15□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 FOXO6A8MYZ6 492 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 KIR2DS3K7RE56 304 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 SH3BP5O60239 455 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 TULP3O75386 442 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 TMCC1O94876 653 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 CYP21A2P08686 494 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 CKMT1AP12532 417 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 KLRC2P26717 231 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 TYK2P29597 1187 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 GJC1P36383 396 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 ME1P48163 572 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 THBS3P49746 956 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 HTR6P50406 440 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 MVDP53602 400 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 RPP30P78346 268 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 RHAGQ02094 409 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 IL13RA2Q14627 380 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 AP5B1Q2VPB7 878 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 EDRF1Q3B7T1 1238 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 WDR45BQ5MNZ6 344 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 MTFR2Q6P444 385 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 AAGABQ6PD74 315 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 GJB7Q6PEY0 223 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 RNF144BQ7Z419 303 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 PELI3Q8N2H9 469 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa3.14□□□□□ -1.91
SNORD3E-201ENST00000362899 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms