RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PIPOXQ9P0Z9 390 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NTMQ9P121 344 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF319Q9P2F9 582 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 B3GAT1Q9P2W7 334 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SNX14Q9Y5W7 946 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RAD54BQ9Y620 910 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTPRDP23468 1912 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP-3.41□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa-3.41□□□□□ -2.95
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GLI3P10071 1580 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DCCP43146 1447 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C1orf226A1L170 272 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTPDC1A2A3K4 754 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MFSD2BA6NFX1 497 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGLL5B9A064 214 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 K7ENM7 598 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 M0R2N6 131 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GYG2O15488 501 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TNFSF12O43508 249 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 APOHP02749 345 aaPredicted RBP-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TFF1P04155 84 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CTSGP08311 255 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NPR2P20594 1047 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 F8A1P23610 371 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SHC1P29353 583 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HOXD13P35453 343 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SELENOPP49908 381 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MFAP4P55083 255 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CDH15P55291 814 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NXPH1P58417 271 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PFKPQ01813 784 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EGR3Q06889 387 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPP2Q13103 211 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KIAA0040Q15053 153 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CEACAM21Q3KPI0 293 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CFAP100Q494V2 611 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CHRFAM7AQ494W8 412 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SGO1Q5FBB7 561 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KCTD11Q693B1 232 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 XRRA1Q6P2D8 792 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CTR9Q6PD62 1173 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HACD2Q6Y1H2 254 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KIF6Q6ZMV9 814 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF627Q7L945 461 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MDGA2Q7Z553 956 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RASAL3Q86YV0 1011 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RIOX2Q8IUF8 465 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KDM8Q8N371 416 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C1orf216Q8TAB5 229 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAGEC3Q8TD91 643 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ITLN1Q8WWA0 313 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 USP6NLQ92738 828 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZUFSPQ96AP4 578 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM70Q9BUB7 260 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 STRA6Q9BX79 667 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BBS2Q9BXC9 721 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MTMR12Q9C0I1 747 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MMP25Q9NPA2 562 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GIMAP4Q9NUV9 329 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF226Q9NYT6 803 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLK2Q9NYY3 685 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TBC1D14Q9P2M4 693 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WNT16Q9UBV4 365 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PCYOX1Q9UHG3 505 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SCOCQ9UIL1 159 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PNMA3Q9UL41 463 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PCDHB8Q9UN66 801 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLAGL2Q9UPG8 496 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RFNGQ9Y644 331 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TJP1Q07157 1748 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTPRFP10586 1907 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VWA3AA6NCI4 1184 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C5orf60A6NFR6 353 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UPK3BL1B0FP48 263 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM220BPB1ANY3 271 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UPK3BL2E5RIL1 263 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLOD2O00469 737 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANKRD28O15084 1053 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC22A2O15244 555 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TBX19O60806 448 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CAND2O75155 1236 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP-3.42□□□□□ -2.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms