RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 SLAIN1Q8ND83 568 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM45AQ8TCE6 357 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CLEC4DQ8WXI8 215 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 KREMEN1Q96MU8 473 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 HPS4Q9NQG7 708 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 TRPC4Q9UBN4 977 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CROTQ9UKG9 612 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ACTL7BQ9Y614 415 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 MARCKSL1P49006 195 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 DEPDC1Q5TB30 811 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM154Q6P9G4 183 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 AFTPHQ6ULP2 937 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM126BQ8IXS8 530 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 DEFB107AQ8IZN7 70 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 TM6SF2Q9BZW4 377 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CAAP1Q9H8G2 361 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 TREHO43280 583 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ADRA1DP25100 572 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ALDH9A1P49189 494 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 GLUD2P49448 558 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 STXBP5Q5T5C0 1151 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 NECAB2Q7Z6G3 386 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ARPINQ7Z6K5 226 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CXorf40AQ8TE69 158 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 SEMA4DQ92854 862 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 OMDQ99983 421 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 HGH1Q9BTY7 390 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 POMKQ9H5K3 350 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 COMMD8Q9NX08 183 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 FMN2Q9NZ56 1722 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 RGS14O43566 566 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 TLL1O43897 1013 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 GLUD1P00367 558 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ANXA5P08758 320 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ETS1P14921 441 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 TRPC1P48995 793 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 DOK6Q6PKX4 331 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 UNC5AQ6ZN44 842 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 BSNDQ8WZ55 320 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 PRRG3Q9BZD7 231 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF510Q9Y2H8 683 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 GSNP06396 782 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 PLK1P53350 603 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 NAA20P61599 178 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ATL1Q8WXF7 558 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 NSMCE2Q96MF7 247 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 GNPTGQ9UJJ9 305 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 TMCO1Q9UM00 188 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 RCCD1A6NED2 376 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CILPO75339 1184 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR15P49685 360 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ACSM2AQ08AH3 577 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC157Q569K6 752 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ACSM2BQ68CK6 577 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 TTC7BQ86TV6 843 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 IRF2BP1Q8IU81 584 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 MIER2Q8N344 545 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ARMC7Q9H6L4 198 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 COL20A1Q9P218 1284 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 A8MX80 341 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 SEPT4O43236 478 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CXCL14O95715 111 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 IMPDH2P12268 514 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CYP3A5P20815 502 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 KRT20P35900 424 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC16A1P53985 500 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 PTPN20Q4JDL3 420 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 SDHAF4Q5VUM1 108 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ACMSDQ8TDX5 336 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC25A23Q9BV35 468 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 KRT84Q9NSB2 600 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 NID2Q14112 1375 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A088AWK7 358 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 TPP1O14773 563 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR47O94967 919 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 CLK2P49760 499 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 PDZD7Q9H5P4 517 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 EFR3BQ9Y2G0 817 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-201ENST00000344528 PIGNO95427 931 aa16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.4 ms