RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339365.2

SEC24C-201, Transcript of SEC24 homolog C, COPII coat complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SEC24C, Length 4,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24C-201ENST00000339365 STBD1O95210 358 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 HLA-DPA1P20036 260 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 LIG3P49916 1009 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 MGAT5Q09328 741 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 HLA-CQ95604 372 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 FBXW11Q9UKB1 542 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 C2CD4BA6NLJ0 364 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 H0YGN5 161 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 CES2O00748 559 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 TGM5O43548 720 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 NOL4O94818 638 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 NFKB1P19838 968 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 PROZP22891 400 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 MMRN1Q13201 1228 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 KIF19Q2TAC6 998 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 RTL10Q7L3V2 364 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 CASD1Q96PB1 797 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 CSPG4P5Q96PW8 444 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 SMOQ99835 787 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 MYOCQ99972 504 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 RABEP2Q9H5N1 569 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP10.99□□□□□ -0.651e-7■■■□□ 15.4
SEC24C-201ENST00000339365 LZTS1Q9Y250 596 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 LAMB2P55268 1798 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 RFPL2O75678 378 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 FGF1P05230 155 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 CASP2P42575 452 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 MAPK9P45984 424 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 AP1S1P61966 158 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 DMC1Q14565 340 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 OR7D4Q8NG98 312 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 PAAF1Q9BRP4 392 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 ASB8Q9H765 288 aa10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 SDK1Q7Z5N4 2213 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 STMN1P16949 149 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 NR1D1P20393 614 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 NDST2P52849 883 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 ITGA9Q13797 1035 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 TCEAL8Q8IYN2 117 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 FBXO36Q8NEA4 188 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 SIPA1Q96FS4 1042 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 EFR3BQ9Y2G0 817 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 SPACA6W5XKT8 324 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 SSC5DA1L4H1 1573 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 LRCH4O75427 683 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 GPR15P49685 360 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 MAXP61244 160 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 GRM2Q14416 872 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 MYO19Q96H55 970 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 CCDC3Q9BQI4 270 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 IL22Q9GZX6 179 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 TRABDQ9H4I3 376 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 ERVK-10P10266 1014 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 LPOP22079 712 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 CD151P48509 253 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 JAM2P57087 298 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 DAB2P98082 770 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 MBLAC2Q68D91 279 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 OR6K2Q8NGY2 324 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 MAGEC3Q8TD91 643 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 GLMNQ92990 594 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 NTAN1Q96AB6 310 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 TLR10Q9BXR5 811 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 CASS4Q9NQ75 786 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 NMRK1Q9NWW6 199 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 GRID1Q9ULK0 1009 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 DYRK1BQ9Y463 629 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 MYO7AQ13402 2215 aa10.98□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 E2F8A0AVK6 867 aa10.97□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 AMD1P17707 334 aa10.97□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 PSMC3P17980 439 aa10.97□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 PSMB4P28070 264 aa10.97□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 HOXD13P35453 343 aa10.97□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 TIE1P35590 1138 aa10.97□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 ABL2P42684 1182 aa10.97□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 DDIASQ8IXT1 998 aa10.97□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 SLC35F5Q8WV83 523 aa10.97□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 CXorf40BQ96DE9 158 aa10.97□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 ABCG4Q9H172 646 aa10.97□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 PHIPQ8WWQ0 1821 aa10.97□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa10.97□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 LEFTY2O00292 366 aa10.97□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 VAPBO95292 243 aa10.97□□□□□ -0.65
SEC24C-201ENST00000339365 RPS24P62847 133 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms