RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319359.7

ELL3-201, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ELL3, Length 2,352 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-201ENST00000319359 ACOT8O14734 319 aa22.09■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 MPOP05164 745 aa22.09■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 FAM58BPP0C7Q3 252 aa22.09■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 MATKP42679 507 aa22.09■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 ART3Q13508 389 aa22.09■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 AFG1LQ8WV93 481 aa22.09■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.09■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 ZNF696Q9H7X3 374 aa22.09■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa22.09■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.09■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 TMCO1Q9UM00 188 aa22.09■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 FIS1Q9Y3D6 152 aa22.09■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 C7orf72A4D263 438 aa22.08■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 CLDN5O00501 218 aa22.08■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 BEST1O76090 585 aa22.08■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 PENKP01210 267 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 HDCP19113 662 aa22.08■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 ME2P23368 584 aa22.08■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 CD68P34810 354 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 SMYD5Q6GMV2 418 aa22.08■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 GK5Q6ZS86 529 aa22.08■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 PGAM4Q8N0Y7 254 aa22.08■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 AHI1Q8N157 1196 aa22.08■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 TMIGD2Q96BF3 282 aa22.08■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 APBA2Q99767 749 aa22.08■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 BFARQ9NZS9 450 aa22.08■■□□□ 1.13
ELL3-201ENST00000319359 I6L893 689 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 PDLIM1O00151 329 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 SPTLC1O15269 473 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 VAPBO95292 243 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 ZBTB17Q13105 803 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 APOFQ13790 326 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 KIZQ2M2Z5 673 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 SLC25A52Q3SY17 297 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 LIPMQ5VYY2 423 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 ZYG11AQ6WRX3 759 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 STRADAQ7RTN6 431 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 LCA5Q86VQ0 697 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 PIGVQ9NUD9 493 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 TCAF2A6NFQ2 919 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 KCNU1A8MYU2 1149 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 M0QYT0 321 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 TMCC1O94876 653 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 AP2A1O95782 977 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 CDK4P11802 303 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 SCNN1BP51168 640 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 BCAT1P54687 386 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 VGLL4Q14135 290 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 MYBPC3Q14896 1274 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 NPWQ8N729 165 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 CCNYL1Q8N7R7 359 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 ADCY4Q8NFM4 1077 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 SGF29Q96ES7 293 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 ZBTB26Q9HCK0 441 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 RHBDL2Q9NX52 303 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 ADA2Q9NZK5 511 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 CDYLQ9Y232 598 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 RNF11Q9Y3C5 154 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 CITO14578 2027 aa22.07■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 FAM200BP0CF97 657 aa22.06■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 HPCAP84074 193 aa22.06■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 DPYSQ14117 519 aa22.06■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 ARHGAP17Q68EM7 881 aa22.06■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 SULF1Q8IWU6 871 aa22.06■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 TTC39CQ8N584 583 aa22.06■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.06■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 SNX10Q9Y5X0 201 aa22.06■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 IRF6O14896 467 aa22.06■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 CNMDO75829 334 aa22.06■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 RPL10P27635 214 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 MGAT5BQ3V5L5 792 aa22.06■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.06■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 PIGZQ86VD9 579 aa22.06■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 MCMBPQ9BTE3 642 aa22.06■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.06■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 DCLK1O15075 740 aa22.05■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 DLX3O60479 287 aa22.05■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 ERCC2P18074 760 aa22.05■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 GABRB3P28472 473 aa22.05■■□□□ 1.12
ELL3-201ENST00000319359 RALGDSQ12967 914 aa22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms