RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 SQLEQ14534 574 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 TSNQ15631 228 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ACSM2BQ68CK6 577 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 IQSEC1Q6DN90 963 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC49Q8IUZ0 686 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 RIBC2Q9H4K1 309 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF112Q9UJU3 913 aa21.44■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 CENPXA8MT69 81 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 AKR1A1P14550 325 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 MARCKSL1P49006 195 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ITGA1P56199 1179 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 TTC27Q6P3X3 843 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 SPATA20Q8TB22 786 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ZMYM5Q9UJ78 669 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 FAM25AB3EWG3 89 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 FAM25CB3EWG5 89 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 FAM25GB3EWG6 89 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB14O43829 449 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 CKBP12277 381 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 NPR3P17342 541 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 NPNTQ6UXI9 565 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ZFPM1Q8IX07 1006 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PHACTR1Q9C0D0 580 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRB2O60241 1585 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 C21orf59P57076 290 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 KRT73Q86Y46 540 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 TPD52L3Q96J77 140 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 OLFM1Q99784 485 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 SESN1Q9Y6P5 492 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 COX4I1P13073 169 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ATP4AP20648 1035 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 HPCAL1P37235 193 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 CHN2P52757 468 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 RTP1P59025 263 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 FAM45AQ8TCE6 357 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 GRK4P32298 578 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ST13P50502 369 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ATP1A4Q13733 1029 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 SPANXN2Q5MJ10 180 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 TRIQKQ629K1 86 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF276Q8N554 614 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 AADATQ8N5Z0 425 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 SERHL2Q9H4I8 314 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 SERHLQ9NQF3 203 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM216Q9P0N5 145 aa21.43■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PTGES3LE9PB15 166 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 UBXN8O00124 270 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 TSPAN3O60637 253 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 TTC23Q5W5X9 447 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 AKT1S1Q96B36 256 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 HSD17B14Q9BPX1 270 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 WDR18Q9BV38 432 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ALG9Q9H6U8 611 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 MAPRE3Q9UPY8 281 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 RGSL1A5PLK6 1076 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ALOX15BO15296 676 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 RDH11Q8TC12 318 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 TYMPP19971 482 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A3Q00325 362 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PDZK1Q5T2W1 519 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF605Q86T29 641 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 FBXW8Q8N3Y1 598 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PGLYRP2Q96PD5 576 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 REEP1Q9H902 201 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 MARCH2Q9P0N8 246 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ROBO3Q96MS0 1386 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 HDAC3O15379 428 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 EPN2O95208 641 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 KCNH1O95259 989 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 RPN2P04844 631 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 CHKAP35790 457 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 CRY1Q16526 586 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 SLC39A12Q504Y0 691 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF621Q6ZSS3 439 aa21.42■■□□□ 1.02
CCSAP-201ENST00000284617 SYT12Q8IV01 421 aa21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms