RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257604.9

TRAFD1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene TRAFD1, Length 3,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1-201ENST00000257604 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 TEX44Q53QW1 395 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 FAM171BQ6P995 826 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 RINLQ6ZS11 566 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 TEX9Q8N6V9 391 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 ARNTL2Q8WYA1 636 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 EXOC2Q96KP1 924 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 RNF208Q9H0X6 261 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 CCSER2Q9H7U1 834 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 CYLDQ9NQC7 956 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 ABCC13Q9NSE7 274 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 HMX2A2RU54 273 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 NBNO60934 754 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 TBX10O75333 385 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 ENO1P06733 434 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 MX2P20592 715 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 NEK3P51956 506 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 PACS1Q6VY07 963 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 AUTS2Q8WXX7 1259 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 RTP4Q96DX8 246 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 SCYL1Q96KG9 808 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 FAM161BQ96MY7 647 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 BRD8Q9H0E9 1235 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 UNC93B1Q9H1C4 597 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 DCLRE1BQ9H816 532 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 J3KR12 359 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 SMAPO00193 183 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 IRAK2O43187 625 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 HAUS5O94927 633 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 PRKCGP05129 697 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 ALFQ53S48 1182 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 RAB41Q5JT25 222 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 RTP2Q5QGT7 225 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 E2F7Q96AV8 911 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 CERS2Q96G23 380 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 DSEQ9UL01 958 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAFD1-201ENST00000257604 MEI4A8MW99 385 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 HACD1B0YJ81 288 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 KIF3CO14782 793 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 ITGA2BP08514 1039 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 RPL34P49207 117 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 TBX4P57082 545 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 IRF9Q00978 393 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 DENND6AQ8IWF6 608 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 NUP93Q8N1F7 819 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 ZNF333Q96JL9 665 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 CYP2S1Q96SQ9 504 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 FTHL17Q9BXU8 183 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 ADAM28Q9UKQ2 775 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 HS3ST4Q9Y661 456 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 E9PAM4 449 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 ADAM12O43184 909 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 TSPAN3O60637 253 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 SPAG6O75602 509 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 TPSB2P20231 275 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 PRPSAP1Q14558 356 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 TPSAB1Q15661 275 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 C11orf91Q3C1V1 193 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 LRRC8BQ6P9F7 803 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 CHSY1Q86X52 802 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 MCUQ8NE86 351 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 PGAM1P18669 254 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 SLC11A1P49279 550 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 KCNQ1P51787 676 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 WASHC2DQ5SRD0 308 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 STOML1Q9UBI4 398 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 PACSIN3Q9UKS6 424 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 GSC2O15499 205 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 SCNN1AP37088 669 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 GLUD2P49448 558 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAFD1-201ENST00000257604 AQP5P55064 265 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms