RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 ARCQ7LC44 396 aa21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 TMIEQ8NEW7 156 aa21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 MDM1Q8TC05 714 aa21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 MPP6Q9NZW5 540 aa21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 DKK4Q9UBT3 224 aa21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 SNX10Q9Y5X0 201 aa21.57■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 DOCK9Q9BZ29 2069 aa21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 TRABD2BA6NFA1 517 aa21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 E9PAM4 449 aa21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 GOLGA8SH3BPF8 625 aa21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 SRGAP2O75044 1071 aa21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 PRNPP04156 253 aa21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 FLT3P36888 993 aa21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 DHRS13Q6UX07 377 aa21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF783Q6ZMS7 281 aa21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 TMPRSS12Q86WS5 348 aa21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF677Q86XU0 584 aa21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 EID2Q8N6I1 236 aa21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 DCAF4L2Q8NA75 395 aa21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 OR2A12Q8NGT7 310 aa21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 CPA5Q8WXQ8 436 aa21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 DYRK4Q9NR20 520 aa21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM59LQ9UK28 342 aa21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 ACACAQ13085 2346 aa21.56■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 A0A0D9SEW6 157 aa21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 ILVBLA1L0T0 632 aa21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 F8VZ95 297 aa21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 CTSLP07711 333 aa21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 MMEP08473 750 aa21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 RRM1P23921 792 aa21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 SLC20A2Q08357 652 aa21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 BNIP3Q12983 259 aa21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 C2CD6Q53TS8 623 aa21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 RETSATQ6NUM9 610 aa21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 KLHDC7BQ96G42 594 aa21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 SPEGQ15772 3267 aa21.55■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 K7ERQ8 282 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 TAS2R38P59533 333 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 NOMO3P69849 1222 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 CAMK2BQ13554 666 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 NAA35Q5VZE5 725 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 BNIPLQ7Z465 357 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 EPS8L1Q8TE68 723 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 CFAP57Q96MR6 1250 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 SPON2Q9BUD6 331 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 ZYG11BQ9C0D3 744 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 GPSM3Q9Y4H4 160 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 DOCK4Q8N1I0 1966 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 FAM149AA5PLN7 773 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 RFPL3O75679 317 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 ENDOD1O94919 500 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 TPM2P07951 284 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 LINGO4Q6UY18 593 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 FAM131BQ86XD5 332 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 MARCH9Q86YJ5 346 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 OR7D4Q8NG98 312 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 PPP1R16AQ96I34 528 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 TAB2Q9NYJ8 693 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 IL36AQ9UHA7 158 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 URB1O60287 2271 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
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NEDD8-201ENST00000250495 A0A1W2PQU0 124 aa21.52■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 FAM170AA1A519 330 aa21.52■■□□□ 1.04
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NEDD8-201ENST00000250495 HNF1BP35680 557 aa21.52■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 CYP4F3Q08477 520 aa21.52■■□□□ 1.04
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NEDD8-201ENST00000250495 CHST14Q8NCH0 376 aa21.52■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 ARRDC3Q96B67 414 aa21.52■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 HDAC8Q9BY41 377 aa21.52■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 CEP44Q9C0F1 390 aa21.52■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 VPS16Q9H269 839 aa21.52■■□□□ 1.04
NEDD8-201ENST00000250495 APC2O95996 2303 aa21.51■■□□□ 1.03
NEDD8-201ENST00000250495 ADAMTS20P59510 1910 aa21.51■■□□□ 1.03
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