RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 MS4A2Q01362 244 aa22.52■■□□□ 1.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 SPTLC1O15269 473 aa22.52■■□□□ 1.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 ATXN10Q9UBB4 475 aa22.51■■□□□ 1.19
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HTATSF1-201ENST00000218364 DPP6P42658 865 aa22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 HCAR3P49019 387 aa22.5■■□□□ 1.19
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HTATSF1-201ENST00000218364 FAM72AQ5TYM5 149 aa22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM72DQ6L9T8 149 aa22.5■■□□□ 1.19
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HTATSF1-201ENST00000218364 FAM72BQ86X60 149 aa22.5■■□□□ 1.19
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HTATSF1-201ENST00000218364 MROH8Q9H579 483 aa22.5■■□□□ 1.19
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HTATSF1-201ENST00000218364 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
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HTATSF1-201ENST00000218364 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 COL6A2P12110 1019 aa22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 PKNOX1P55347 436 aa22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 SCAPQ12770 1279 aa22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
HTATSF1-201ENST00000218364 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
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