RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216014.8

KDELR3-201, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 1,728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-201ENST00000216014 NSMCE3Q96MG7 304 aa20.39■□□□□ 0.85
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KDELR3-201ENST00000216014 ERVW-1Q9UQF0 538 aa20.39■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
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KDELR3-201ENST00000216014 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
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KDELR3-201ENST00000216014 MX2P20592 715 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 CCNCP24863 283 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 STARD6P59095 220 aa20.36■□□□□ 0.85
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KDELR3-201ENST00000216014 ZNF234Q14588 700 aa20.36■□□□□ 0.85
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KDELR3-201ENST00000216014 SEPT10Q9P0V9 454 aa20.36■□□□□ 0.85
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KDELR3-201ENST00000216014 PTPN3P26045 913 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 TIE1P35590 1138 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 IL12RB1P42701 662 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 WASP42768 502 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 C2orf27AQ580R0 203 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 SH2D3CQ8N5H7 860 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 FRS2Q8WU20 508 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 EXOC2Q96KP1 924 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 C2orf42Q9NWW7 574 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 LHX3Q9UBR4 397 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 HS3ST2Q9Y278 367 aa20.36■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 F5H423 210 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 PHF2O75151 1096 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 JCHAINP01591 159 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 HLA-DQB2P05538 268 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 COILP38432 576 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 PRKCQQ04759 706 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 ZNF852Q6ZMS4 543 aa20.35■□□□□ 0.85
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KDELR3-201ENST00000216014 ACDQ96AP0 544 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 TNKS2Q9H2K2 1166 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 TBC1D17Q9HA65 648 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 LTB4R2Q9NPC1 389 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 STARD13Q9Y3M8 1113 aa20.35■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 NCAM2O15394 837 aa20.34■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 KCNN4O15554 427 aa20.34■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 CCNB1P14635 433 aa20.34■□□□□ 0.85
KDELR3-201ENST00000216014 CD68P34810 354 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
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