RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gle1Q8R322 699 aa22.31■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TxlnbQ8VBT1 685 aa22.31■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Papd4Q91YI6 484 aa22.31■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc39a3Q99K24 317 aa22.31■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Creld2Q9CYA0 350 aa22.31■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Elf2Q9JHC9 593 aa22.31■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atp11cQ9QZW0 1129 aa22.31■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fut8Q9WTS2 575 aa22.31■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm5538W4VSP6 401 aa22.31■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam43bA2AM80 330 aa22.3■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Serpine3E9Q6A2 401 aa22.3■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zc3h12bG3X9I7 835 aa22.3■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Adcy1O88444 1118 aa22.3■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 AladP10518 330 aa22.3■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Naaladl1Q7M758 745 aa22.3■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Znf423Q80TS5 1292 aa22.3■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Q8BGC1 442 aa22.3■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pde10aQ8CA95 790 aa22.3■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atg14Q8CDJ3 492 aa22.3■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tldc1Q8K0P3 455 aa22.3■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fermt3Q8K1B8 665 aa22.3■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tram1l1Q8QZR0 363 aa22.3■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Znf426Q8R1D1 550 aa22.3■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 AslQ91YI0 464 aa22.3■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rnf112Q96DY5 654 aa22.3■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trem2Q99NH8 227 aa22.3■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Bzw1Q9CQC6 419 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Efhc2Q9D485 750 aa22.3■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc25a19Q9DAM5 318 aa22.3■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nphs1Q9QZS7 1256 aa22.3■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ror1Q9Z139 937 aa22.3■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm13283A0A087WPG5 182 aa22.29■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 BC024978J3QPC3 361 aa22.29■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vmn2r88L7N1W8 857 aa22.29■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TyrobpO54885 114 aa22.29■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc22a2O70577 553 aa22.29■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CskP41241 450 aa22.29■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 IqcmQ149I8 489 aa22.29■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Taar7aQ5QD12 358 aa22.29■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 StilQ60988 1262 aa22.29■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sim2Q61079 657 aa22.29■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Klra3Q64329 266 aa22.29■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tdpoz4Q6YCH2 370 aa22.29■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 FdpsQ920E5 353 aa22.29■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc22a3Q9WTW5 551 aa22.29■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cacna1eQ61290 2272 aa22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prrg1A2BFE8 218 aa22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm13285B1AYI3 182 aa22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm13275B1AYI8 182 aa22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Adgrf2E9Q4J9 644 aa22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fbrsl1E9Q9T0 1031 aa22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm3460E9QAI8 215 aa22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp715G3X9T1 886 aa22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krt19P19001 403 aa22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pabpc1P29341 636 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gmeb2P58929 530 aa22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SbdsP70122 250 aa22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Bcl2a1cQ0P538 128 aa22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 ZufspQ3T9Z9 577 aa22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zmym5Q3U2E2 627 aa22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Them6Q80ZW2 207 aa22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 IfnzQ8BQT1 182 aa22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Med19Q8C1S0 244 aa22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm13278Q8CD73 182 aa22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gsto2Q8K2Q2 248 aa22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cd207Q8VBX4 331 aa22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cog2Q921L5 731 aa22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mrfap1Q9CQL7 125 aa22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rrp15Q9CYX7 281 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cwc15Q9JHS9 229 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CtsrQ9JIA9 334 aa22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hacl1Q9QXE0 581 aa22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 OtofQ9ESF1 1997 aa22.28■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Igkv10-95A0A0G2JFY3 115 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Bpifb9bA2AJD1 591 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm5926E9PWJ8 236 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm4450E9Q007 373 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vmn2r76E9Q3F5 853 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 LipiF6YQT7 476 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tap1P21958 724 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SmoP56726 793 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sycp3P70281 254 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Htr4P97288 388 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vps45P97390 570 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sap25Q1EHW4 186 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Usp30Q3UN04 517 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hsd3b4Q61767 373 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tas2r129Q7M709 320 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tubb2aQ7TMM9 445 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nrde2Q80XC6 1172 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Bpifb9aQ80XI7 591 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cdc23Q8BGZ4 597 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp719Q8BIV1 735 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cdh7Q8BM92 785 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Actl9Q8CG27 415 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Setd7Q8VHL1 366 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Elp2Q91WG4 831 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tubb2bQ9CWF2 445 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ndufv2Q9D6J6 248 aa22.27■■□□□ 1.16
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Il1rl2Q9ERS7 574 aa22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20 ms