RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025522.10

Pdgfrb-201, Transcript of Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdgfrb, Length 5,407 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Larp4bQ6A0A2 741 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Il33Q8BVZ5 266 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 CgasQ8C6L5 507 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ces2aQ8QZR3 558 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sytl2Q99N50 950 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Spatc1lQ9D9W0 342 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hcar2Q9EP66 360 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Thap11Q9JJD0 305 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ap3m1Q9JKC8 418 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PtprvP70289 1705 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Psmc3O88685 442 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfm3P63056 478 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 CamkmtQ3U2J5 323 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Yipf3Q3UDR8 347 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nr6a1Q64249 495 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SvoplQ6PDF3 494 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fbxo30Q8BJL1 746 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Clec4a3Q8JZX6 237 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Scgb2b18A0A087WPA9 112 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 KapP61110 121 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prl2c1Q5SVL9 228 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dnali1Q8BVN8 258 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Efl1Q8C0D5 1127 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pabpc5Q8C7D3 381 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 ZwilchQ8R060 589 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sike1Q9CPR7 207 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Oxct2bQ9ESL0 520 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Oxct2aQ9JJN4 520 aa11.12□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ctnnd2O35927 1247 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Csn1s1P19228 313 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 FynP39688 537 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pdss1Q33DR2 409 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nlrp4fQ66X05 959 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gadl1Q80WP8 550 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tspan18Q80WR1 248 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 MafaQ8CF90 359 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pdlim2Q8R1G6 349 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dnajc3Q91YW3 504 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Kdelr1Q99JH8 212 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mrps9Q9D7N3 390 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr704Q9EPF6 315 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Robo1O89026 1612 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zfp990B1AVN5 605 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Atp9aO70228 1047 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 RpsaP14206 295 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rpl3P27659 403 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pgs1Q8BHF7 553 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ago1Q8CJG1 857 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 IntS13Q8QZV7 732 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 AclyQ91V92 1091 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Epn3Q91W69 636 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Taldo1Q93092 337 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Efcab9Q9DAM2 216 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slfn14V9GXG1 899 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Magea10A2AMW4 325 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 MaptP10637 733 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Brcc3P46737 291 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tas2r16P59529 299 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Col6a2Q02788 1034 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Samd3Q8C4H2 520 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr342Q8VGK7 312 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Arih2Q9Z1K6 492 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm7275E9Q1B3 247 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cdc6O89033 562 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tlr12Q6QNU9 906 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SugctQ7TNE1 436 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Igdcc3Q8BQC3 813 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rsl1d1Q8BVY0 452 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Anapc2Q8BZQ7 837 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Creld1Q91XD7 420 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tas1r3Q925D8 858 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Q9CQF4 240 aa11.11□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn2r111K7N674 857 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prl2c2P04095 224 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Il2rbP16297 539 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Msr1P30204 458 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mfsd14aP70187 490 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dusp11Q6NXK5 321 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Q8C5S3 137 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Oma1Q9D8H7 521 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Klhdc7aA2APT9 773 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Igf2bp1O88477 577 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 InvsO89019 1062 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 MafbP54841 323 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lhx1P63006 406 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cdk7Q03147 346 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Znf800Q0VEE6 662 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mtnr1aQ61184 353 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 FukQ7TMC8 1090 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gpr61Q8C010 449 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Robo4Q8C310 1012 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mcoln3Q8R4F0 553 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 NoboxQ8VIH1 527 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mrps2Q924T2 291 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lgals2Q9CQW5 130 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Anks3Q9CZK6 655 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 B4galt5Q9JMK0 388 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mrpl40Q9Z2Q5 206 aa11.1□□□□□ -0.63
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn2r70K7N702 854 aa11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 76.5 ms