RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000003554.10

Casq1-201, Transcript of Calsequestrin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casq1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ap2a1P17426 977 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 PrkcgP63318 697 aa16.39■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Serpinb6dQ3UWK8 375 aa16.39■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Grxcr1Q50H32 290 aa16.39■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gngt1Q61012 74 aa16.39■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gpr65Q61038 337 aa16.39■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ggnbp1Q6K1E7 370 aa16.39■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zmpste24Q80W54 475 aa16.39■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zfp454Q80Y34 536 aa16.39■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Psapl1Q8C1C1 522 aa16.39■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Scara3Q8C850 606 aa16.39■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Q8CC96 669 aa16.39■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 RhoqQ8R527 205 aa16.39■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Elmod3Q91YP6 381 aa16.39■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mcoln1Q99J21 580 aa16.39■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 SardhQ99LB7 919 aa16.39■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pramef12Q9D2F1 463 aa16.39■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tlr9Q9EQU3 1032 aa16.39■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cacng3Q9JJV5 315 aa16.39■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm28510A0A087WP28 240 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm29133A0A1B0GT72 266 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vmn1r176G3UW31 304 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Atxn10P28658 475 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 MagohP61327 146 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cdh6P97326 790 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mc1rQ01727 315 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cd300lgQ1ERP8 331 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mgat5bQ765H6 792 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 TwistnbQ78WZ7 330 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zic5Q7TQ40 622 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Q80WR5 230 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Brd8Q8R3B7 951 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 MagohbQ9CQL1 146 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmem135Q9CYV5 458 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mpp6Q9JLB0 553 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fibcd1A2AV25 459 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cldn2O88552 230 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tap1P21958 724 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 MipP51180 263 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 PhbP67778 272 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Lig3P97386 1015 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Foxred2Q3USW5 665 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sco1Q5SUC9 284 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rxfp4Q7TQP4 414 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zfp719Q8BIV1 735 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmtc3Q8BRH0 920 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ano4Q8C5H1 955 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ndufa10Q99LC3 355 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Klhdc8bQ9D2D9 354 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fam227bQ9D518 532 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 DonsonQ9QXP4 560 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Krt71Q9R0H5 524 aa16.38■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm20431E9PY39 371 aa16.37■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Atp2a2O55143 1044 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfm1O88998 485 aa16.37■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sbk3P0C5K0 361 aa16.37■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Nfkb1P25799 971 aa16.37■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gna12P27600 379 aa16.37■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mmp13P33435 472 aa16.37■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 VegfcP97953 415 aa16.37■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 IqcmQ149I8 489 aa16.37■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 HnrnpdQ60668 355 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Trim24Q64127 1051 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cdc14bQ6PFY9 485 aa16.37■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Zbtb41Q811F1 908 aa16.37■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Noc4lQ8BHY2 516 aa16.37■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fzd10Q8BKG4 582 aa16.37■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Snx30Q8CE50 437 aa16.37■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gbp5Q8CFB4 590 aa16.37■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Aldh4a1Q8CHT0 562 aa16.37■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Pitrm1Q8K411 1036 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Sike1Q9CPR7 207 aa16.37■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mfsd10Q9D2V8 456 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Trip4Q9QXN3 581 aa16.37■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rad9aQ9Z0F6 389 aa16.37■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Vmn2r70K7N702 854 aa16.36■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Exoc7O35250 697 aa16.36■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Limk2O54785 638 aa16.36■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 PargO88622 969 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 DcxO88809 366 aa16.36■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Myl4P09541 193 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 CremP27699 357 aa16.36■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Cd244Q07763 397 aa16.36■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tpp2Q64514 1262 aa16.36■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ankrd6Q69ZU8 712 aa16.36■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gpr17Q6NS65 339 aa16.36■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Ccnt2Q7TQK0 723 aa16.36■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Mterf2Q8BKY8 385 aa16.36■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tarsl2Q8BLY2 790 aa16.36■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tbc1d17Q8BYH7 645 aa16.36■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Fcho1Q8K285 873 aa16.36■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Tmem82Q8R115 356 aa16.36■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Yaf2Q99LW6 179 aa16.36■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Armc9Q9D2I5 817 aa16.36■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 DtnaQ9D2N4 746 aa16.36■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Rmi1Q9D4G9 616 aa16.36■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Trbv4A0A075B5I2 113 aa16.35■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Igkv16-104A0A0B4J1I1 116 aa16.35■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Olfr1049A2ARZ0 308 aa16.35■□□□□ 0.21
Casq1-201ENSMUST00000003554 Gm7073E9QAS1 335 aa16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44.6 ms