RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635554.1

AP001206.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AP001206.1, Length 720 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP001206.1-201ENST00000635554 SHROOM3Q8TF72 1996 aa9.51□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 ASPMQ8IZT6 3477 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 A0A1B0GTH6 734 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 A0A1B0GTW7 788 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 FAM47DPA6NHR8 397 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 LRRC53A6NM62 1247 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 CCP110O43303 1012 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 RTN2O75298 545 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 CLDN11O75508 207 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 FSBPO95073 299 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 RHOCP08134 193 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 ADRA1BP35368 520 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 ACVRL1P37023 503 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 PTPN9P43378 593 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 ADPRHP54922 357 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 TAS2R38P59533 333 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 ARF5P84085 180 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 ZBTB16Q05516 673 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 SLC12A1Q13621 1099 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 DLG2Q15700 870 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 KIF19Q2TAC6 998 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 WDR45BQ5MNZ6 344 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 KIAA0895LQ68EN5 471 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 NCEH1Q6PIU2 408 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 USP30Q70CQ3 517 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 ARCQ7LC44 396 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 NLRP14Q86W24 1093 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 HDDC3Q8N4P3 179 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 NETO2Q8NC67 525 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 CEP76Q8TAP6 659 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 FAM172AQ8WUF8 416 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 FOXJ1Q92949 421 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 ARRDC3Q96B67 414 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 C1orf74Q96LT6 269 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 SLC6A18Q96N87 628 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 TRIM7Q9C029 511 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 KLC2Q9H0B6 622 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 BTBD1Q9H0C5 482 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 CBX8Q9HC52 389 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 ADAM22Q9P0K1 906 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 VPS28Q9UK41 221 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 SNX11Q9Y5W9 270 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 MYLKQ15746 1914 aa9.5□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 IGF2RP11717 2491 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 ZZEF1O43149 2961 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 TMCO5BA8MYB1 307 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 BNIP3LO60238 219 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 SH3BP5O60239 455 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 MOCS3O95396 460 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 F9P00740 461 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 IL1BP01584 269 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 SKILP12757 684 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 PBX1P40424 430 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 DPP6P42658 865 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 ZNF165P49910 485 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 SNX16P57768 344 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 CNTN1Q12860 1018 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 NR1I3Q14994 352 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 SHBQ15464 509 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 HLA-BQ31612 363 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 SYCP2LQ5T4T6 812 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 AGBL4Q5VU57 503 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 TRIM72Q6ZMU5 477 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 LEKR1Q6ZMV7 388 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 LUZP1Q86V48 1076 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 DRC7Q8IY82 874 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 MCOLN2Q8IZK6 566 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 C3orf20Q8ND61 904 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 OR2A12Q8NGT7 310 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 HAPLN3Q96S86 360 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 MUC3BQ9H195 1237 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 TNKS2Q9H2K2 1166 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 FBRSQ9HAH7 460 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 SGK2Q9HBY8 427 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 PPM1HQ9ULR3 514 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 HS3ST2Q9Y278 367 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 CA5BQ9Y2D0 317 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 BTBD3Q9Y2F9 522 aa9.49□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 A0A1W2PR77 199 aa9.48□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 SIGLEC16A6NMB1 481 aa9.48□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 H0Y8X5 98 aa9.48□□□□□ -0.89
AP001206.1-201ENST00000635554 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms