RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 PLD4Q96BZ4 506 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGEF26Q96DR7 871 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 CDC6Q99741 560 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 TLR10Q9BXR5 811 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 TM9SF3Q9HD45 589 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 SCUBE2Q9NQ36 999 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF14Q9UBS8 474 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 LCMT1Q9UIC8 334 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 CES2O00748 559 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 CTIFO43310 598 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 CYBBP04839 570 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 NAA35Q5VZE5 725 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 C11orf63Q6NUN7 778 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP18Q8N392 663 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP112Q8N8E3 955 aa24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNK3O14649 394 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 CALB1P05937 261 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 SGSHP51688 502 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 TKTL1P51854 596 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS14P62263 151 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 PTP4A2Q12974 167 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 SGO2Q562F6 1265 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 LCLAT1Q6UWP7 414 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD52Q8NB46 1076 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 WFDC5Q8TCV5 224 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 BIRC7Q96CA5 298 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 ULBP1Q9BZM6 244 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 PRSS16Q9NQE7 514 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 STRIP2Q9ULQ0 834 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 HYOU1Q9Y4L1 999 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 O00370 1275 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 KALRNO60229 2985 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPAN3O60637 253 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 CD19P15391 556 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 BRD2P25440 801 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 GRIA4P48058 902 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 MPPE1Q53F39 396 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAAF5Q86Y56 855 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 WDTC1Q8N5D0 677 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 CPA5Q8WXQ8 436 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF653Q96CK0 615 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAM22Q9P0K1 906 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 TRABD2BA6NFA1 517 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 ENC1O14682 589 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBED1O96006 694 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 CALCAP01258 141 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 PDE4CQ08493 712 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 E2F5Q15329 346 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 SNX19Q92543 992 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCB8Q9NUT2 735 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 SCINQ9Y6U3 715 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 KNTC1P50748 2209 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM149AA5PLN7 773 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 C10orf142B7Z368 130 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 H0Y8X5 98 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHGA12O60330 932 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 SEMA4FO95754 770 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 CTSKP43235 329 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 GSCP56915 257 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP4F3Q08477 520 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 CHST9Q7L1S5 443 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 MSANTD4Q8NCY6 345 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 IGSF8Q969P0 613 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 MYO19Q96H55 970 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 CRELD1Q96HD1 420 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 LMLNQ96KR4 655 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 MIS12Q9H081 205 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA8CPA6NN73 597 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 TNFSF14O43557 240 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 GABBR2O75899 941 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV4-34P06331 123 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 SETSIPP0DME0 302 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS6KA1Q15418 735 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 DAAM2Q86T65 1068 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 NT5DC3Q86UY8 548 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 MNS1Q8NEH6 495 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 STK32AQ8WU08 396 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 LRIG1Q96JA1 1093 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 PARVAQ9NVD7 372 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 GGA2Q9UJY4 613 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 AMFRQ9UKV5 643 aa24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CAPNS1-216ENST00000628306 YJEFN3A6XGL0 299 aa24.83■■□□□ 1.57
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