RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 CBX4O00257 560 aa8.71□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 URI1O94763 535 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 KAT7O95251 611 aa8.71□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 APODP05090 189 aa8.71□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 GLULP15104 373 aa8.71□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 GLDCP23378 1020 aa8.71□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 ETFBP38117 255 aa8.71□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 NR2C2P49116 596 aa8.71□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 GALK1P51570 392 aa8.71□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
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SGMS1-211ENST00000626236 GEN1Q17RS7 908 aa8.71□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 PLEKHG6Q3KR16 790 aa8.71□□□□□ -1.02
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SGMS1-211ENST00000626236 MSANTD3Q96H12 275 aa8.71□□□□□ -1.02
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SGMS1-211ENST00000626236 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
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SGMS1-211ENST00000626236 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
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SGMS1-211ENST00000626236 J3KR12 359 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 MCF2LO15068 1137 aa8.7□□□□□ -1.02
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SGMS1-211ENST00000626236 AP1B1Q10567 949 aa8.7□□□□□ -1.02
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SGMS1-211ENST00000626236 PDK1Q15118 436 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 NOMO1Q15155 1222 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM215Q68D42 235 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 MBLAC2Q68D91 279 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 LINGO4Q6UY18 593 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF852Q6ZMS4 543 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 LEKR1Q6ZMV7 388 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 NUDT18Q6ZVK8 323 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa8.7□□□□□ -1.02
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SGMS1-211ENST00000626236 ADIPOR2Q86V24 386 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 SIX5Q8N196 739 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 DCAF4L2Q8NA75 395 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 C1orf54Q8WWF1 131 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 SORCS1Q8WY21 1168 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 ATG4AQ8WYN0 398 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 FAM3CQ92520 227 aa8.7□□□□□ -1.02
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SGMS1-211ENST00000626236 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 AP1M1Q9BXS5 423 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 SP110Q9HB58 689 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 WNT16Q9UBV4 365 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 VPS51Q9UID3 782 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 RAD54BQ9Y620 910 aa8.7□□□□□ -1.02
SGMS1-211ENST00000626236 TRIOO75962 3097 aa8.69□□□□□ -1.02
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