RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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CTDP1-208ENST00000613122 SDHAF4Q5VUM1 108 aa20.48■□□□□ 0.87
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CTDP1-208ENST00000613122 ATL1Q8WXF7 558 aa20.47■□□□□ 0.87
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CTDP1-208ENST00000613122 DNAJC18Q9H819 358 aa20.47■□□□□ 0.87
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CTDP1-208ENST00000613122 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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CTDP1-208ENST00000613122 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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CTDP1-208ENST00000613122 POLR1DQ9Y2S0 133 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-208ENST00000613122 MROH2AA6NES4 1674 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-208ENST00000613122 JAK1P23458 1154 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-208ENST00000613122 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-208ENST00000613122 RAD23AP54725 363 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-208ENST00000613122 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-208ENST00000613122 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-208ENST00000613122 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-208ENST00000613122 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.46■□□□□ 0.87
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