RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	ACBD6	Q9BR61	282 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CFAP54	Q96N23	3096 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232		A0A1W2PQ67	120 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	RARG	P13631	454 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	BLMH	Q13867	455 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PDK2	Q15119	407 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC1A5	Q15758	541 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	NAT16	Q8N8M0	369 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PMM1	Q92871	262 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PHF21B	Q96EK2	531 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	HBEGF	Q99075	208 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	WHRN	Q9P202	907 aa		10.04	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232		A0A1W2PQH9	124 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	OR51F1	A6NGY5	319 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	B4GALT3	O60512	393 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	VAPB	O95292	243 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	NOS2	P35228	1153 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	MUM1	Q2TAK8	710 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	LAYN	Q6UX15	382 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	AGT	P01019	485 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	APOC2	P02655	101 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	LTF	P02788	710 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	TRIM60	Q495X7	471 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	SUSD3	Q96L08	255 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM210A	Q96ND0	272 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	AAAS	Q9NRG9	546 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	FBXO21	O94952	628 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CCR10	P46092	362 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	LONP2	Q86WA8	852 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ALLC	Q8N6M5	410 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ART4	Q93070	314 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP2A3	Q93084	1043 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	P2RY11	Q96G91	374 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	VCX	Q9H320	206 aa		10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	10.03	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	NBAS	A2RRP1	2371 aa		10.02	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PER2	O15055	1255 aa		10.02	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	AHCYL1	O43865	530 aa		10.02	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	GK	P32189	559 aa		10.02	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PTPN9	P43378	593 aa		10.02	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	DAOA	P59103	153 aa		10.02	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	PLD1	Q13393	1074 aa		10.02	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		10.02	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		10.02	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		10.02	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	SEC14L1	Q92503	715 aa		10.02	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CENPT	Q96BT3	561 aa		10.02	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		10.02	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		10.02	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		10.02	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	MUC3A	Q02505	3323 aa		10.02	□□□□□ -0.8
CTCFL-222	ENST00000609232	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	DPPA5	A6NC42	116 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	GPR39	O43194	453 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	CKM	P06732	381 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	KCNQ1	P51787	676 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	IL9R	Q01113	521 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	PIF1	Q9H611	641 aa		10.02	□□□□□ -0.81
CTCFL-222	ENST00000609232	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		10.02	□□□□□ -0.81

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