RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581761.5

MKS1-211, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 3

Gene MKS1, Length 812 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-211ENST00000581761 RASA4BC9J798 803 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 F5H5T6 163 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 MATN3O15232 486 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 RASA4O43374 803 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 COCHO43405 550 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 ACSL4O60488 711 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 MAFKO60675 156 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 LILRB3O75022 631 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 NEBLO76041 1014 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 SUN1O94901 812 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 CTSAP10619 480 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 CCNB1P14635 433 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 KRT15P19012 456 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 PPP3CCP48454 512 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 ANO4Q32M45 955 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 CASC4Q6P4E1 433 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 KLHDC10Q6PID8 442 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 UNC5AQ6ZN44 842 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 ITIH5Q86UX2 942 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 LGI2Q8N0V4 545 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 GSDMBQ8TAX9 411 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 DHRS4Q9BTZ2 278 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 TRABDQ9H4I3 376 aa14.94□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 SHROOM3Q8TF72 1996 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 BRAFP15056 766 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 CREB1P16220 341 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 BMPR1AP36894 532 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 MAPKAPK2P49137 400 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 SLC11A2P49281 568 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 HARS2P49590 506 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 DMTNQ08495 405 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 STEAP4Q687X5 459 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 ADGRD1Q6QNK2 874 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 OTOP3Q7RTS5 596 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 TRABD2AQ86V40 505 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 ZNF354CQ86Y25 554 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 CTAGE3PQ8IX95 158 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 KLHL23Q8NBE8 558 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 OR52K1Q8NGK4 314 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 GDPD5Q8WTR4 605 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 DCAKDQ8WVC6 231 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 PSMG2Q969U7 264 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 CENPTQ96BT3 561 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 HMCESQ96FZ2 354 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 IL12RB2Q99665 862 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 LRRC40Q9H9A6 602 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 SP110Q9HB58 689 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 GLOD4Q9HC38 313 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 CASS4Q9NQ75 786 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 SYBUQ9NX95 663 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 IKBKGQ9Y6K9 419 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 NUP205Q92621 2012 aa14.93□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 TMEM120BA0PK00 339 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 C5orf67F2Z3F1 127 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 PIAS1O75925 651 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 CXCL14O95715 111 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 HLA-DQB2P05538 268 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 INHBAP08476 426 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 CNPP09543 421 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 SPATA31D3P0C874 917 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 IRF1P10914 325 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 PGAM1P18669 254 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 OLIG2Q13516 323 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 KCTD11Q693B1 232 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 CCNJLQ8IV13 435 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 CNTD1Q8N815 330 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 PPM1NQ8N819 430 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 MGARPQ8TDB4 240 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 SLC44A1Q8WWI5 657 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 MYEOVQ96EZ4 313 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 FCRL5Q96RD9 977 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 RABEP2Q9H5N1 569 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 PLAC1Q9HBJ0 212 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 TRPC7Q9HCX4 862 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 SENP1Q9P0U3 644 aa14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa14.91□□□□□ -0.02
MKS1-211ENST00000581761 C2orf78A6NCI8 922 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms