RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LRFN2Q9ULH4 789 aa21.76■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PLXNA3P51805 1871 aa21.76■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HOXA2O43364 376 aa21.75■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TIMM44O43615 452 aa21.75■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NEBLO76041 1014 aa21.75■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ALDH2P05091 517 aa21.75■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 YWHAQP27348 245 aa21.75■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LIMK2P53671 638 aa21.75■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 STX3Q13277 289 aa21.75■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa21.75■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa21.75■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KCNMB4Q86W47 210 aa21.75■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CEP57Q86XR8 500 aa21.75■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CRLF3Q8IUI8 442 aa21.75■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SEPT8Q92599 483 aa21.75■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KIFC1Q9BW19 673 aa21.75■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KCNK4Q9NYG8 393 aa21.75■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GMIPQ9P107 970 aa21.75■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM92AA1XBS5 289 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MPOP05164 745 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FGFR3P22607 806 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GRK4P32298 578 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HADHAP40939 763 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAGEA12P43365 314 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OCRLQ01968 901 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZBTB16Q05516 673 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SDHAF4Q5VUM1 108 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARMC3Q5W041 872 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PDPK2PQ6A1A2 396 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CLNKQ7Z7G1 428 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FATE1Q969F0 183 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM237Q96Q45 408 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 APOL2Q9BQE5 337 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KCNK13Q9HB14 408 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UBP1Q9NZI7 540 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HEY2Q9UBP5 337 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NUDT5Q9UKK9 219 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 H7C4K7 107 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PLIN3O60664 434 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SNNO75324 88 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RHOQP17081 205 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GPR15P49685 360 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRMT2P55345 433 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PCID2Q5JVF3 399 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARTNQ5T4W7 220 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPPL2BQ8TCT7 592 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAGEC3Q8TD91 643 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FBXO32Q969P5 355 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CASD1Q96PB1 797 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PGLYRP2Q96PD5 576 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 THAP1Q9NVV9 213 aa21.74■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NBNO60934 754 aa21.73■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HAUS5O94927 633 aa21.73■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TARSP26639 723 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NDST2P52849 883 aa21.73■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MTA1Q13330 715 aa21.73■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC153Q494R4 210 aa21.73■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa21.73■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PIK3R6Q5UE93 754 aa21.73■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C14orf80Q86SX3 495 aa21.73■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa21.73■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KIF2BQ8N4N8 673 aa21.73■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DCLK2Q8N568 766 aa21.73■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DBF4BQ8NFT6 615 aa21.73■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MFSD3Q96ES6 412 aa21.73■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SIKE1Q9BRV8 207 aa21.73■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZYG11BQ9C0D3 744 aa21.73■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CHRAC1Q9NRG0 131 aa21.73■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SNX15Q9NRS6 342 aa21.73■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EMCNQ9ULC0 261 aa21.73■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa21.72■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CHUKO15111 745 aa21.72■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATP6V1G2O95670 118 aa21.72■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CPB1P15086 417 aa21.72■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TPH1P17752 444 aa21.72■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CDK7P50613 346 aa21.72■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MPP3Q13368 585 aa21.72■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PKN3Q6P5Z2 889 aa21.72■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATAD1Q8NBU5 361 aa21.72■■□□□ 1.07
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms