RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 CDC20Q12834 499 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 MAPK7Q13164 816 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 XRCC4Q13426 336 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 KLHL38Q2WGJ6 581 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 CDONQ4KMG0 1287 aa5.65□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 CLVS2Q5SYC1 327 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 CEP85LQ5SZL2 805 aa5.65□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 TPRA1Q86W33 373 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 DNAJC10Q8IXB1 793 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 CCDC105Q8IYK2 499 aa5.65□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 STAMQ92783 540 aa5.65□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 CCDC42Q96M95 316 aa5.65□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 WRNIP1Q96S55 665 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 DMRTA2Q96SC8 542 aa5.65□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 TPK1Q9H3S4 243 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 NEK6Q9HC98 313 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 VTA1Q9NP79 307 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 NRIP3Q9NQ35 241 aa5.65□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 WHRNQ9P202 907 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 C5AR2Q9P296 337 aa5.65□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 CYTH4Q9UIA0 394 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 SIK3Q9Y2K2 1263 aa5.65□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa5.65□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 FHOD1Q9Y613 1164 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 PIAS3Q9Y6X2 628 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 SALL1Q9NSC2 1324 aa5.65□□□□□ -1.51
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF609O15014 1411 aa5.65□□□□□ -1.51
CAPN3-211ENST00000562199 LAMA4Q16363 1823 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPN3-211ENST00000562199 SPEF2Q9C093 1822 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPN3-211ENST00000562199 ARHGAP23Q9P227 1491 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPN3-211ENST00000562199 A0A0A6YYJ9 748 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPN3-211ENST00000562199 A0A1W2PQ27 194 aa5.64□□□□□ -1.51
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CAPN3-211ENST00000562199 A0A1W2PQD8 194 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPN3-211ENST00000562199 CCDC151A5D8V7 595 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPN3-211ENST00000562199 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa5.64□□□□□ -1.51
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CAPN3-211ENST00000562199 SLCO1B7G3V0H7 640 aa5.64□□□□□ -1.51
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CAPN3-211ENST00000562199 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CAPN3-211ENST00000562199 GPRIN2O60269 458 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPN3-211ENST00000562199 ULK1O75385 1050 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPN3-211ENST00000562199 SPAG6O75602 509 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPN3-211ENST00000562199 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CAPN3-211ENST00000562199 PRAMEF12O95522 483 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPN3-211ENST00000562199 OTCP00480 354 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPN3-211ENST00000562199 GSNP06396 782 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPN3-211ENST00000562199 CTSBP07858 339 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPN3-211ENST00000562199 NFICP08651 508 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPN3-211ENST00000562199 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CAPN3-211ENST00000562199 FGFR1P11362 822 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPN3-211ENST00000562199 KRT3P12035 628 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPN3-211ENST00000562199 GJA1P17302 382 aa5.64□□□□□ -1.51
CAPN3-211ENST00000562199 M6PRP20645 277 aa5.64□□□□□ -1.51
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