RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556007.6

TIMM9-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 9, human

TSL 3 BASIC

Gene TIMM9, Length 746 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM9-208	ENST00000556007	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		4.08	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	NPHP1	O15259	732 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	KRT86	O43790	486 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	CYP1A2	P05177	515 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	CHRNB2	P17787	502 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	AKT1	P31749	480 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	ZP1	P60852	638 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	ABAT	P80404	500 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	TRAF1	Q13077	416 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	PKP1	Q13835	747 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	TRIM14	Q14142	442 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	KRT81	Q14533	505 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	CRB3	Q9BUF7	120 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	ICK	Q9UPZ9	632 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		4.07	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	CD53	P19397	219 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	TNFSF8	P32971	234 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	PPM1A	P35813	382 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	TEC	P42680	631 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	ENTPD1	P49961	510 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	DSCR9	P59020	149 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	GPR18	Q14330	331 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007		Q6ZTK2	550 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	HMGB4	Q8WW32	186 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		4.06	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007		I6L893	689 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	FFAR2	O15552	330 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	HLA-DQA2	P01906	255 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	RCAN1	P53805	252 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	OAZ1	P54368	228 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	DSC1	Q08554	894 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	STARD3	Q14849	445 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	SHB	Q15464	509 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	BTBD16	Q32M84	506 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007		Q6ZTC4	211 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	TICAM2	Q86XR7	235 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	CADM3	Q8N126	398 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	STYX	Q8WUJ0	223 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	SCLT1	Q96NL6	688 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	HIPK3	Q9H422	1215 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	KLHL31	Q9H511	634 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007		Q9N2J8	555 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	FZD10	Q9ULW2	581 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007		A0A1B0GVT2	93 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	GLUD1	P00367	558 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	MYZAP	P0CAP1	466 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	GNLY	P22749	145 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	PRPH2	P23942	346 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	PCP4	P48539	62 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	GLUD2	P49448	558 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	PCYT1A	P49585	367 aa		4.04	□□□□□ -1.76
TIMM9-208	ENST00000556007	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76

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