RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	TMC6	Q7Z403	805 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	DDI1	Q8WTU0	396 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	WDR70	Q9NW82	654 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	NAGPA	Q9UK23	515 aa		14.27	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ADCY5	O95622	1261 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ZBED1	O96006	694 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	CD38	P28907	300 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ACADSB	P45954	432 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	RGS7	P49802	495 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	PPP2CB	P62714	309 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	PPP2CA	P67775	309 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ADIG	Q0VDE8	80 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	PDCL	Q13371	301 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	LINC00303	Q3SY05	128 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	TMEM110	Q86TL2	294 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	SCML4	Q8N228	414 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	14.26	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	RFFL	Q8WZ73	363 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	14.26	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	DNAJC7	Q99615	494 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	AGPAT1	Q99943	283 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	CEP83	Q9Y592	693 aa		14.26	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	MID1	O15344	667 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	EFS	O43281	561 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	MFAP3L	O75121	409 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	TPM1	P09493	284 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	METAP1	P53582	386 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	NXPH1	P58417	271 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	NOMO3	P69849	1222 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	SLC25A45	Q8N413	288 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	CPXM1	Q96SM3	734 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	GDF3	Q9NR23	364 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ST7	Q9NRC1	585 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	14.25	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222		E5RJQ4	531 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	TLR4	O00206	839 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	NPC1	O15118	1278 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	FFAR2	O15552	330 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	DFNA5	O60443	496 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	CS	O75390	466 aa	Known RBP	14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	FBXO21	O94952	628 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	SERPING1	P05155	500 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	SKIL	P12757	684 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	LCP1	P13796	627 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	CDC25B	P30305	580 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	NAA35	Q5VZE5	725 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	WDR59	Q6PJI9	974 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	DRC7	Q8IY82	874 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	SERAC1	Q96JX3	654 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	NOX5	Q96PH1	765 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	FAM117A	Q9C073	453 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	SGK2	Q9HBY8	427 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		14.24	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222		A0A1B0GVM2	712 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	SLC12A8	A0AV02	714 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222		K7ENP7	123 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	PIK3R2	O00459	728 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	SIN3B	O75182	1162 aa		14.23	□□□□□ -0.13
CS-231	ENST00000552222	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	14.23	□□□□□ -0.13

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