RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 FAM46CQ5VWP2 391 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 OR6B2Q6IFH4 312 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 FBXL22Q6P050 247 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 IQCHQ86VS3 1027 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 OR13H1Q8NG92 308 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 OR4C6Q8NH72 309 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 RNF34Q969K3 372 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 FAM131CQ96AQ9 280 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 BTN2A3PQ96KV6 586 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 FAM204AQ9H8W3 233 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 PPM1HQ9ULR3 514 aa16.56■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa16.55■□□□□ 0.24
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CS-227ENST00000551441 CTSLP07711 333 aa16.55■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 SULT2A1Q06520 285 aa16.55■□□□□ 0.24
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CS-227ENST00000551441 HS1BP3Q53T59 392 aa16.55■□□□□ 0.24
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CS-227ENST00000551441 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
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CS-227ENST00000551441 CRTC1Q6UUV9 634 aa16.55■□□□□ 0.24
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CS-227ENST00000551441 C14orf80Q86SX3 495 aa16.55■□□□□ 0.24
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CS-227ENST00000551441 VANGL2Q9ULK5 521 aa16.55■□□□□ 0.24
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CS-227ENST00000551441 K7ERQ8 282 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 ERVH48-1M5A8F1 160 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 CASC3O15234 703 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 SLC7A4O43246 635 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 ATP9BO43861 1147 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 SNAP91O60641 907 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 PIAS2O75928 621 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 IGLV3-25P01717 112 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 TMPRSS3P57727 454 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 SLC12A1Q13621 1099 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 RABGAP1LQ5R372 815 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 CDCP2Q5VXM1 449 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 SEL1L3Q68CR1 1132 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 FOXR1Q6PIV2 292 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 DEFB106AQ8N104 65 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa16.54■□□□□ 0.24
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CS-227ENST00000551441 DDIT4Q9NX09 232 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa16.54■□□□□ 0.24
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CS-227ENST00000551441 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa16.53■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 FAM170AA1A519 330 aa16.53■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 PMS2P1A4D2B8 440 aa16.53■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 TCAF2A6NFQ2 919 aa16.53■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 MCF2LO15068 1137 aa16.53■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 ENDOD1O94919 500 aa16.53■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 PCDH8O95206 1070 aa16.53■□□□□ 0.24
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CS-227ENST00000551441 C3orf38Q5JPI3 329 aa16.53■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa16.53■□□□□ 0.24
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CS-227ENST00000551441 SH2D3CQ8N5H7 860 aa16.53■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 TMEM145Q8NBT3 493 aa16.53■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 HIC2Q96JB3 615 aa16.53■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 DEPDC7Q96QD5 511 aa16.53■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 SLC4A5Q9BY07 1137 aa16.53■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 ABCG4Q9H172 646 aa16.53■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 PREBQ9HCU5 417 aa16.53■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP16.53■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 RMND1Q9NWS8 449 aa16.53■□□□□ 0.24
CS-227ENST00000551441 DNAJC28Q9NX36 388 aa16.53■□□□□ 0.24
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