RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		11.78	□□□□□ -0.52
CS-223	ENST00000551137	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		11.78	□□□□□ -0.52
CS-223	ENST00000551137	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		11.78	□□□□□ -0.52
CS-223	ENST00000551137	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		11.78	□□□□□ -0.52
CS-223	ENST00000551137	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
CS-223	ENST00000551137	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		11.78	□□□□□ -0.52
CS-223	ENST00000551137	MUC3B	Q9H195	1237 aa		11.78	□□□□□ -0.52
CS-223	ENST00000551137	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		11.78	□□□□□ -0.52
CS-223	ENST00000551137	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		11.78	□□□□□ -0.52
CS-223	ENST00000551137	SLC32A1	Q9H598	525 aa		11.78	□□□□□ -0.52
CS-223	ENST00000551137	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		11.78	□□□□□ -0.52
CS-223	ENST00000551137	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		11.78	□□□□□ -0.52
CS-223	ENST00000551137	MPP6	Q9NZW5	540 aa		11.78	□□□□□ -0.52
CS-223	ENST00000551137	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		11.78	□□□□□ -0.52
CS-223	ENST00000551137	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		11.78	□□□□□ -0.52
CS-223	ENST00000551137	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		11.78	□□□□□ -0.52
CS-223	ENST00000551137		A0A1W2PPC4	97 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	LRRC72	A6NJI9	287 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	GIPC1	O14908	333 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	LAT	O43561	262 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	ZMPSTE24	O75844	475 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	RHOC	P08134	193 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	SRC	P12931	536 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	VAV1	P15498	845 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	OR1E1	P30953	314 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	DRD3	P35462	400 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	HDAC4	P56524	1084 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	NR1I3	Q14994	352 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	FIGN	Q5HY92	759 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	WDR59	Q6PJI9	974 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	NLRP14	Q86W24	1093 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	OMD	Q99983	421 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	VPS51	Q9UID3	782 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	WASF3	Q9UPY6	502 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137		A0A0D9SEW6	157 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137		A0A1W2PP55	124 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	SNAP91	O60641	907 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	SRGAP2	O75044	1071 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	CER1	O95813	267 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	MT-CO1	P00395	513 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	IL1B	P01584	269 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	GZMA	P12544	262 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	RHOQ	P17081	205 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	GPD1	P21695	349 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	NUDT1	P36639	197 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	ETFB	P38117	255 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	PRKCI	P41743	596 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	PSMD8	P48556	350 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	MAPKAPK2	P49137	400 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	AIF1	P55008	147 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	TEAD4	Q15561	434 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	RAB6C	Q53S08	254 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	PLPP6	Q8IY26	295 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	DEFB124	Q8NES8	71 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	TMIE	Q8NEW7	156 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	CCDC114	Q96M63	670 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	CNPY3	Q9BT09	278 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	CEP44	Q9C0F1	390 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	SARDH	Q9UL12	918 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	NEU3	Q9UQ49	428 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		11.76	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	CACNA1B	Q00975	2339 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	FAM72C	H0Y354	149 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	VILL	O15195	856 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	DFNA5	O60443	496 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	LRIG2	O94898	1065 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	FSBP	O95073	299 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	PTMS	P20962	102 aa		11.75	□□□□□ -0.53
CS-223	ENST00000551137	L1CAM	P32004	1257 aa		11.75	□□□□□ -0.53

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