RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550974.1

GPN3-208, Transcript of GPN-loop GTPase 3, human

TSL 5

Gene GPN3, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPN3-208	ENST00000550974	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	C16orf46	Q6P387	395 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	SKAP1	Q86WV1	359 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	MFN1	Q8IWA4	741 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	RBFA	Q8N0V3	343 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	HVCN1	Q96D96	273 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	HIVEP1	P15822	2718 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	POM121B	A6NF01	834 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	YY2	O15391	372 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	JAK2	O60674	1132 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	KIF20A	O95235	890 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	ARSD	P51689	593 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	KIF11	P52732	1056 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	ADGRF1	Q5T601	910 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	HORMAD1	Q86X24	394 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	WDR49	Q8IV35	697 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	GPD1L	Q8N335	351 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	C12orf29	Q8N999	325 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	LMLN	Q96KR4	655 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	ACCS	Q96QU6	501 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	SPAG5	Q96R06	1193 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	MAP10	Q9P2G4	905 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	KCND3	Q9UK17	655 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	PDZD2	O15018	2839 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	MED13L	Q71F56	2210 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	RAD1	O60671	282 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	NUMB	P49757	651 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	MYL6	P60660	151 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	ECT2L	Q008S8	904 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	MCM6	Q14566	821 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	SURF1	Q15526	300 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	DCAF6	Q58WW2	860 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	SFR1	Q86XK3	245 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	ARL10	Q8N8L6	244 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	PMEPA1	Q969W9	287 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	LURAP1	Q96LR2	239 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	RUBCNL	Q9H714	662 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	GPR27	Q9NS67	375 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	SDK2	Q58EX2	2172 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	ESPL1	Q14674	2120 aa		11.62	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	ZNF233	A6NK53	670 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	LMO7DN	F2Z398	122 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	SPINT1	O43278	529 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	PPP1R37	O75864	691 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	PCDH8	O95206	1070 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	PDGFA	P04085	211 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	SLFN14	P0C7P3	912 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	TNNI1	P19237	187 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	TRPC3	Q13507	836 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	PTK2B	Q14289	1009 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GPN3-208	ENST00000550974	NEK5	Q6P3R8	708 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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