RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 KLRG1Q96E93 195 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 SH3GL3Q99963 347 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 CDT1Q9H211 546 aa8.64□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 PRDM8Q9NQV8 689 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 NINJ2Q9NZG7 142 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 FNIP2Q9P278 1114 aa8.64□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 PTP4A2Q12974 167 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 EPS8L1Q8TE68 723 aa8.63□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 ASTN1O14525 1302 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 COL6A1P12109 1028 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 ELP6Q0PNE2 266 aa8.63□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 ZNF229Q9UJW7 825 aa8.63□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 ZACNQ401N2 412 aa8.63□□□□□ -1.03
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PTPRB-208ENST00000550358 KCNT1Q5JUK3 1230 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 KCNT2Q6UVM3 1135 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 C10orf53Q8N6V4 93 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 PLD4Q96BZ4 506 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 RNF157Q96PX1 679 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 HSD17B14Q9BPX1 270 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 PACSIN1Q9BY11 444 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 BBIP1A8MTZ0 92 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 EML1O00423 815 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 EOMESO95936 686 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRB-208ENST00000550358 MMP3P08254 477 aa8.62□□□□□ -1.03
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