RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 CLCN6P51797 869 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 ARF5P84085 180 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 CACNA1BQ00975 2339 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 GAD2Q05329 585 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 ZP2Q05996 745 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 AP1B1Q10567 949 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 WASHC5Q12768 1159 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 ZBTB17Q13105 803 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 XRCC4Q13426 336 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 GEN1Q17RS7 908 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 PLEKHG6Q3KR16 790 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 PARP15Q460N3 678 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 LINGO4Q6UY18 593 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 MMGT1Q8N4V1 131 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 ATPAF2Q8N5M1 289 aa8.33□□□□□ -1.08
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CS-216ENST00000549221 ALLCQ8N6M5 410 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 CCNYQ8ND76 341 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 MNS1Q8NEH6 495 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 CCDC114Q96M63 670 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 HINFPQ9BQA5 517 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 FEM1AQ9BSK4 669 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 LRRC1Q9BTT6 524 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 SPON2Q9BUD6 331 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 MAGEH1Q9H213 219 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 EPC1Q9H2F5 836 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 RETREG1Q9H6L5 497 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 ATP13A1Q9HD20 1204 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 THEGQ9P2T0 379 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 PCYOX1Q9UHG3 505 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 ZNF148Q9UQR1 794 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 RAD54BQ9Y620 910 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 V9GYY5 206 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 SPTBN4Q9H254 2564 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 SHROOM3Q8TF72 1996 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 ARHGAP42A6NI28 874 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 SHISA7A6NL88 538 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 HACD1B0YJ81 288 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 RNF103O00237 685 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 MUSKO15146 869 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 KCNN4O15554 427 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 PRAMEF11O60813 436 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 GJB3O75712 270 aa8.32□□□□□ -1.08
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CS-216ENST00000549221 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
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CS-216ENST00000549221 PTPN3P26045 913 aa8.32□□□□□ -1.08
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CS-216ENST00000549221 SLC10A7Q0GE19 358 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 TRADDQ15628 312 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 PITRM1Q5JRX3 1037 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 TEX35Q5T0J7 233 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 IL31Q6EBC2 164 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 ZNF783Q6ZMS7 281 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 ADIPOR2Q86V24 386 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 JAMLQ86YT9 394 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 ADHFE1Q8IWW8 467 aa8.32□□□□□ -1.08
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CS-216ENST00000549221 CCDC105Q8IYK2 499 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 PLCD3Q8N3E9 789 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 PGBD5Q8N414 524 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 CPA6Q8N4T0 437 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 CNTD1Q8N815 330 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 DCAF4L2Q8NA75 395 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 CCDC110Q8TBZ0 833 aa8.32□□□□□ -1.08
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CS-216ENST00000549221 SORCS1Q8WY21 1168 aa8.32□□□□□ -1.08
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CS-216ENST00000549221 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 SLCO2A1Q92959 643 aa8.32□□□□□ -1.08
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CS-216ENST00000549221 RTP4Q96DX8 246 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 TSGA13Q96PP4 275 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 MUC3BQ9H195 1237 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 BRD9Q9H8M2 597 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 HOMER3Q9NSC5 361 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-216ENST00000549221 SEPT10Q9P0V9 454 aa8.32□□□□□ -1.08
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